1、定义不同
SPA：SPA一词源于拉丁文“Solus Par Agula”（Health by water）的字首，Solus（健康），Par（在）， Agula（水中），意指用水来达到健康，健康之水。
水疗：水疗(hydrotherapy)是利用不同温度、压力和溶质含量的水， 以不同方式作用于人体以防病治病的方法。
2、起源不同
SPA：关于SPA一词起源的探讨中有一个词始终贯穿其中，那就是“水疗”，它反映了水在古时的治疗领域和早期欧洲SPA文化中的重要作用。多数人认为SPA一词是一些拉丁短语的首字母组合，如“sanitas per aquam”，“solus per aquam ”，“sanus per aquam”。
这些短语都有“用水治疗”的意思。另一种说法是SPA源于在罗马浴室中发现的涂鸦“salut per aquam”。SPA也可能源于瓦龙语的“espa”，意思是喷泉，或源于拉丁语“spagere”，意思是泼水。
有些专家认为该词源于比利时一个以温泉著称的叫spa的小镇。后来，spa一词就被用于温泉和提供水疗的疗养胜地。在19、20世纪，饮用矿泉水或在矿泉中洗浴成为时尚的休闲方式。
水疗：早在古希腊时代，西方医学之父希波克拉提斯(Hippocrates)就使用温泉做治疗，此外古代中国、日本亦有温泉疗法的记载。
直到18世纪-19世纪，德国水疗之父Sebastian Kneipp等人发表，将水疗做为正式医疗用途。水疗常用来治疗肌肉、骨骼等方面的疾病，而坊间流行的“SPA”亦为水疗的一种。
3、种类不同
SPA：依照SPA的不同用途来区分可分为：都会型SPA（Day Spa）、美容SPA（Beauty Spa） 俱乐部SPA（Club Spa）、 饭店/度假村SPA（Hotel/Restort Spa）、温泉型SPA（Mineral Spring Spa Hair SPA。
水疗：可分浸浴、淋浴、喷射浴、漩水浴、气泡浴等；按其温度可分热水浴（39℃以上）、温水浴（37-38℃）、不感温水浴（34-36℃）、低温水浴（26-33℃）和冷水浴（<26摄氏度）；按其所含药物可分碳酸浴、松脂浴、盐水浴和淀粉浴等。
参考资料来源：百度百科-SPA
参考资料来源：百度百科-水疗
水疗是SPA的一部分，比如热海水冲浪，水力按摩池，太空舱等这些可以算作为水疗，SPA包括了：水疗，精油按摩，瑜伽，冥想，面部护理，身体保养等等。
再举个简单的例子：你再去SPA会所做护理，首先泡浴，然后护理师点上香薰灯做去角质，再然后是精油按摩，最后给你做个面部护理让你静静的睡觉。其中的各个形式的泡浴就是简单的水疗。（复杂点的还有水中瑜伽，水中康复，水中冥想等等）
因为在做SPA时总是离不开水，所以很多人以为水疗就是SPA，其实水疗只是SPA的组成部分，可以代指，但是绝对不能代替。本回答被网友采纳
SPA：SPA一词源于拉丁文“SolusParAgula”（Healthbywater）的字首，Solus（健康），Par（在），Agula（水中），意指用水来达到健康，健康之水。
水疗：水疗(hydrotherapy)是利用不同温度、压力和溶质含量的水，以不同方式作用于人体以防病治病的方法。
2、起源不同
SPA：关于SPA一词起源的探讨中有一个词始终贯穿其中，那就是“水疗”，它反映了水在古时的治疗领域和早期欧洲SPA文化中的重要作用。多数人认为SPA一词是一些拉丁短语的首字母组合，如“sanitasperaquam”，“solusperaquam”，“sanusperaquam”。
这些短语都有“用水治疗”的意思。另一种说法是SPA源于在罗马浴室中发现的涂鸦“salutperaquam”。SPA也可能源于瓦龙语的“espa”，意思是喷泉，或源于拉丁语“spagere”，意思是泼水。
有些专家认为该词源于比利时一个以温泉著称的叫spa的小镇。后来，spa一词就被用于温泉和提供水疗的疗养胜地。在19、20世纪，饮用矿泉水或在矿泉中洗浴成为时尚的休闲方式。
水疗：早在古希腊时代，西方医学之父希波克拉提斯(Hippocrates)就使用温泉做治疗，此外古代中国、日本亦有温泉疗法的记载。
直到18世纪-19世纪，德国水疗之父SebastianKneipp等人发表，将水疗做为正式医疗用途。水疗常用来治疗肌肉、骨骼等方面的疾病，而坊间流行的“SPA”亦为水疗的一种。
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3、种类不同
SPA：依照SPA的不同用途来区分可分为：都会型SPA（DaySpa）、美容SPA（BeautySpa）俱乐部SPA（ClubSpa）、饭店/度假村SPA（Hotel/RestortSpa）、温泉型SPA（MineralSpringSpaHairSPA。
水疗：可分浸浴、淋浴、喷射浴、漩水浴、气泡浴等；按其温度可分热水浴（39℃以上）、温水浴（37-38℃）、不感温水浴（34-36℃）、低温水浴（26-33℃）和冷水浴（<26摄氏度）；按其所含药物可分碳酸浴、松脂浴、盐水浴和淀粉浴等。
参考资料来源：/baike.baidu.com/item/SPA/278455?fr=aladdin#3"target="_blank"title="只支持选中一个链接时生效">百度百科-SPA
参考资料来源：/baike.baidu.com/item/%E6%B0%B4%E7%96%97/5370671?fr=aladdin"target="_blank"title="只支持选中一个链接时生效">百度百科-水疗
通俗易懂的SPA：沐浴+涂抹保养品+精油结合不同手法来按摩
看视频容易了解
上海日式轻奢SPA
官方的SPA：
SPA（水疗）
SPA一词源于拉丁文“Solus Par Agula”（Health by water）的字首：Solus（健康），Par（在）， Agula（水中），意指用水来达到健康，健康之水。SPA是指利用水资源结合沐浴、按摩、涂抹保养品和香熏来促进新陈代谢，满足人体视觉、味觉、触觉、嗅觉和思考达到一种身心畅快的享受。
SPA是由专业美疗师、水、光线、芳香精油、音乐等多个元素组合而成的舒缓减压方式，能帮助人达到身、心、灵的健美效果。
早期
SPA早期仅是以具疗效的温泉和矿泉区为主，至今演变成一种人人都可享受，并且集休闲、美容、减压于一体的休闲健康新概念。这样的演变是随着时代潮流的推进以及现代人对休闲生活的日益重视而形成的。SPA （源于拉丁文 Solus Par Agula），意为“健康之水”，与英式休闲文化的SPA（Spring pute air）意为“在矿泉区里享受纯净的空气”。SPA的美妙气息蔓延了几百年-希腊的文献旧时就有记载，在水中加上矿物及香薰、草药、鲜花，可以预防疾病及延缓衰老。
国际SPA协会对SPA的定义是：SPA致力于通过提供鼓励更新观念，身体和精神的各种专业服务，提高人们的整体健康水平。从狭义上讲SPA指的就是水疗美容与养生。形式各异的SPA，包括冷水浴、热水浴、冷热水交替浴、海水浴、温泉浴、自来水浴，每一种浴都能在一定程度上松弛、缓和紧张、疲惫的肌肉和神经，排除体内毒素，预防和治疗疾病，另外水疗配合各种芳香精油按摩，会加速脂肪燃烧、具有瘦身的效果。
近现代
从广义上讲，SPA包括人们熟知的水疗、芳香按摩、沐浴、去死角等等。现代SPA主要透过人体的五大感官功能，即听觉（疗效音乐）、味觉（花草茶、健康饮食）、触觉（按摩、接触）、嗅觉（天然芳香精油）、视觉（自然或仿自然景观、人文环境）等达到全方位的放松，将精、气、神三者合一，实现身、心、灵的放松，如今SPA逐渐演变成现代美丽补给的代名词。
水疗是SPA最普遍的形式。据考SPA的名字起源于罗马帝国时期比利时的一个叫“SPA”的小镇，因为那里有一温泉，可以美容甚至治疗疾病而闻名。
到了近代，科学家才揭开温泉的秘密，水中的精油成分来源于当地山上成千上万种花卉草木在上游水源的浸积。人们模拟建造类似的环境及水质，使其对人体具有健康及健美作用，即为现代的“SPA”。
SPA有不同的主题诉求，有的偏重放松、舒缓、排毒的疗程；有的以健美瘦身为重点；还有的重在芳香精油、海洋活水或纯草本疗法等。但无论是哪种类型的SPA，都不脱离满足客人听觉（疗效音乐）、嗅觉（天然花草薰香）、视觉（自然景观）、味觉（健康餐饮）、触觉（按摩呵护）和感觉（内心放松）等6种愉悦感官的基本需求。 SPA的愉悦身心，为内心囤积的压力、疲惫、惶惑找到一个出口，令人的身、心、灵达到和谐与平衡的享受。身、心、灵皆美是现代身处亚健康状态的都市人的梦想。SPA吹来的怡人芳香，正是从身、心、灵上给人以关怀和抚慰，呵护的容颜、关爱你的心灵，让你由内至外充满生机、神采飞扬。
参考资料 https://baike.baidu.com/item/SPA/278455
水疗是SPA的一部分，比如热海水冲浪，水力按摩池，太空舱等这些可以算作为水疗，SPA包括了：水疗，精油按摩，瑜伽，冥想，面部护理，身体保养等等。
再举个简单的例子：你再去SPA会所做护理，首先泡浴，然后护理师点上香薰灯做去角质，再然后是精油按摩，最后给你做个面部护理让你静静的睡觉。其中的各个形式的泡浴就是简单的水疗。（复杂点的还有水中瑜伽，水中康复，水中冥想等等）
因为在做SPA时总是离不开水，所以很多人以为水疗就是SPA，其实水疗只是SPA的组成部分，可以代指，但是绝对不能代替。