湖南省机关事务管理局根据其职责设有多个内设机构，具体如下:
办公室: 负责机关的日常运转，包括文电、会务、机要、档案等工作；负责信息、保密、安全、信访、政务公开、新闻发布，以及规章制度的起草和监督实施；指导全省机关事务工作政策和后勤体制改革，协调解决后勤相关问题，并负责省后勤体制改革领导小组办公室的日常工作。
国有资产管理处: 管理省委等大院及省直单位的国有资产，包括公务用车的编制、配备与更新；负责外宾礼品、公派出国人员礼品和控制社会集团购买力的管理工作；管理局机关及直属单位的国有资产。
房地产管理处: 对省直机关房产实施管理，制定相关制度并监督执行，参与房地产监管，负责住房制度改革和保障工作，土地使用权管理和公务员集中住宅区建设、管理等事务。
公共机构节能管理处: 在政府节能部门指导下，负责省直公共机构节能工作，进行能耗统计、监测和考核，制定节能规划并实施，处理公共机构节能工作领导小组的日常事务。
物业管理服务处: 制定物业政策、监督实施，协调处理物业管理服务，负责房屋维修、危旧房改造和政策保障性住宅维修资金管理工作，以及公务员集中住宅区的物业和社会事务工作。
财务管理处: 协调财务工作，管理公务用车经费，负责局机关和直属单位的财务指导监督。
接待服务处: 负责会议经费管理、省级领导同志生活服务、来宾接待、会议后勤及全省驻长机构的管理和协调，管理公务接待汽车队。
人事处: 负责机关和直属单位的人事管理、机构编制、劳动工资事务，协助开展工人技术培训等工作，负责教育培训机构和幼儿园的管理。
机关常委负责党群工作，纪检（监察）机构负责内部审计工作。
湖南省机关事务管理局成立于1956年，为省政府直属一级行政厅局，主要为省委、人大、政府、政协和省直单位提供后勤保障和服务。