其实，在回答问题之前，我希望大家可以理清：佛陀是佛陀，佛教是佛教，先不要把我们今天眼睛看到的“佛教”一律归纳为佛陀就是这样教导。佛陀，是历史上确确实实的人物，这个事实没有什么好争论，但是至于“佛教”，我指的佛教是今天我们看到的各种“说法(Theory)”，各种礼仪，各种特色风格……不能完全代表佛陀最原来的教法。
为何这么说？因为当我们要把一样东西和另一样东西画上等号（A=B）时，一定要有证据。既然说佛陀是一个历史上存在的人物，自然会有通过考古得来的证据。但是至于很多书籍或者弘法的人所说的“佛法”是不是与佛陀所教导的符合？这个也是要去探讨的！不能单单靠“感应”，靠他讲“这是规矩”等等来衡量！绝对不能。因为，是佛说就是佛说，是你说的，就绝对不可以说是佛陀说的，这样是误人子弟！偏偏很多明明是自己说的，他们都很喜欢说这是佛陀说的！所以，我们学习佛法要不断的突破，突破那个圈圈，去寻找佛陀最原本的教法！
我们常常喜欢说“学佛，学佛”，其实如果我们换另一个方式说“学习佛法”，或者我们的修行方向会比较明确，因为本来佛陀就是要我们学习佛法，注意，是学习“佛法”。教导不到我们佛法的地方，再怎么富丽堂皇的“道场”，佛像再怎么庄严，再怎么多人护持，其实也只不过是建筑物／场所而已。教导不到佛法，就是教导不到，不能勉强要我们继续跟从。
当然，我们不能说现今教导不到我们佛法的地方／人都是邪教，不能一边倒。就好像教导不到我们医学的小学科学老师，我们不可以鄙视他们，不可以随便毁谤他们，因为我们也要先学好科学才能学医，但是当你发现科学老师能够教导的就不过如此，我们就要突破，去寻找可以教导我们生物学的，然后是医学的。可是，可能等到你学医的时候，你才会发现以前小学的科学有一些东西不那么正确，讲解也太笼统。
学习佛法也一样，总要有一个让我们认识佛教的基础，但是过后，就要不断提升和深入。偏偏现在的“道场”“宗门”这么多，我们就陷入一个困境了。我们这种困境，跟一个人很相似——阐陀比丘。
http://www.ss.ncu.edu.tw/~calin/article2008/8j.pdf 学习佛法，不能人家喂你吃什么，你就吞什么。有疑惑一定要提出来，一定要思考，不然那不叫作学习佛法，那是信仰！人言你就受。要学习，无论如何都要从四圣谛和十二因缘学习起，毕竟那就是佛陀最初的教法，就好比学校的第一堂课。错过第一堂课，接下来的很难跟得上，如果有没有人能好好解答我们的疑问，我们甚至会离开，对佛教会失望……那是很可悲的。佛陀是一个说话直接，让人容易明白道理的老师，要向佛陀学习，根本不需要“信仰”的。如果什么都不对我们讲解清楚，只要我们相信，那和婆罗门有何差别呢？
学习佛法，要一面了解因缘法之外，也要一面了解佛教的历史，才能看到什么说法是在后期才出现，什么说法是一直从佛陀时代就传到今天的。这样，你学习佛法就不会那么苦恼了！
佛陀涅磐至今有2400年左右〔根据学者研究，佛陀于公元前390年涅磐，前后年差不超过十年（根据Indian Buddhism By Hajime Nakamura，pg14）〕。阿育王（Asoka）不是佛陀时代的人，他是佛陀涅磐后100年的人物。
*******
至于你的对话中的疑问，我尝试分享：
1）
我：佛家宣示众生平等，可想得到“出世间的利益”，就必须跪拜焚香，可我觉得跪拜顶礼之类举动，是奴性的一种表现，根本谈不上平等啊？
她：……
我：难道有了功德，成了佛，就一定要高高在上，让别人跪拜么？普通人就不能挺直腰杆，光靠做好事成佛么？
她：虽然不很合理，但规矩已经定好了，也只能遵从。
我：谁定的这规矩啊？真不合理！
[在这个情况之下，无可否认，佛陀并没有要我们崇拜他，反而佛陀就是一个要突破这种“崇拜式的信仰”的人。至于对于佛陀的礼敬，实际上是佛陀的弟子因为听闻了佛法，十分感动和感恩，才对佛陀礼敬。但是，这并不是一个没有跟从就会被“处罚”的规矩。不过，我们身为学佛者，要是真的发自内心很感恩他，礼敬他也不必感到扭捏，就自然就好，何必刻意？]
2）
所谓行善行恶，其实也是要分析判断的。可有些事情的善和恶并不明显，是见仁见智的，有时候甚至是说不清的。在佛家理论中，应该是冥冥中有一个裁决机制，给不同的情况打了分，可有些事情就说不清，比如为了赚钱救父而去卖shen，不大好判断的，那怎么裁定呢？
而且满天神佛，万一有了不同意见，以谁为主呢？
如何来保障这个裁决机制的公正性和正确性呢？
[“在佛家理论中，应该是冥冥中有一个裁决机制，给不同的情况打了分”其实，不要乱说哦，所谓的冥冥中有一个裁决机制，并不是佛陀说的哦，如果是佛陀说的，经过考古是会找到证据的。很可能是后期人受了一般传统信仰的影响尔也把这个概念采纳进入佛教。佛教一向来就是很无辜的被各种文化和风俗影响……那么佛陀是怎么说的呢？这个要三言两语就讲解不完。你可以从十二因缘中了解，不过要参考《相应部阿含经》或者《杂阿含》，才不会混淆。不要让电视剧和传说故事里的“佛教”把你弄混淆了哦。]
3）
我：很好奇各个佛的地位，这些佛是从属关系，还是并列关系啊？是各管一部分分工，但又有个一把手统一管理么？就像皇帝和各部尚书一样？
她：……
我：佛要是犯了错，会不会贬为凡人啊？
她：……
[你已经把佛陀纳入“天庭制度”的一个人物啦。或者你把佛陀从这个“神化式”“西游记式”的概念中拉出来，问题就解决了。因为所谓的“地位”“贬为凡人”都是人们把我们的世间里的“机制”套给我们“信仰”中的神仙“用”。佛陀是一个历史人物，要记得，他是一个人物。你要理清着一个，一定要了解佛教历史，还要以学术角度了解，有历史根据的方式。如果要以信仰的角度，你很难突破那些疑惑，因为信仰中的一切都无法证明任何事实。]
4）
曾看过一个真实的故事，一个居士带着七岁的孩子定居英国，这个孩子认识了一个外国孩子，一天两人在外玩耍，都热得无法忍受，………………难道我们的收获和幸福，不该靠自己的双手来获得么？不该靠努力工作去换取么？怎么能把希望寄托在索要和祈求上呢？
她：面又有不悦之色。
[同样的问题，一个人可以是中国人，但是不代表他的每一句话都是他从中国学来的，难道他没有自己的见解吗？同样的，虽然那位居士是佛教徒，不代表他教导的一切就是佛陀教导的。况且，“忍忍忍”这个思想会比较受中国人观念影响多过佛教。虽然佛教里有“六度波罗蜜的忍辱”，但是，就如我一开始说的，要把佛教和佛陀分清楚，六度是在公元2世纪才出现的思想。但是这也不代表佛陀要我们什么都不用忍，也不是这样一边倒的。佛陀教导的是智慧，完全跟“拜拜祈求”是没有关系的，那为什么今天佛教会这样子？怪就怪人们摆脱不了“祈求”。而且要强调，不同地方的佛教都走到不同阶段，在中国，佛教基本上还是停留在和民间信仰没有差别的阶段，但是在大马、新加坡、台湾……佛教已经是一种研究和学术可以考究的学问。]
5）
放下屠刀的恶人，我们应该大度原谅么？ …………其实已经没有任何关系了啊？
她：我不知道。
[这个问题或者要分清两个部分：(A)对于别人的原谅和(B)法律刑罚制度。简单来说，这两个都是一个“制度”，而且每个人的那一把尺都不一样，就有不同的观点，争论到底都很难有结论。你能原谅一个人到什么程度，再怎么说都是以你的见解来衡量，是你个人的事情；法律如何去裁决一个人，也是有一群人去决定的，是他们的见解。在佛教里，有业报的说法，但是没有一个人去订制度，而是(C)自己做自己受。现在你问的问题却把ABC混在一起衡量，她当然想不通啊也回答不到。我只能说国家有国家的法律，人民犯了法自然要坦然接受处罚；做了让世人唾弃的坏事，也无法避免被世人轻易原谅，犯过法的人也是有这个心理准备的；但是至于你个人，你无法原谅人家，就要看你自己觉得怎样了，你可不能自己来处治他，另外，如果你一直把他放在心去怨恨，也只会增加你的心灵负担，你还有更多的事务要处理和关心，如果一个人的行为完全在你的控制范围以外，你就不要再拿他的坏行为来折磨自己的心灵。如果真的发现一个人犯法，你有责任报警。]
6）
……礼佛叩首，就得好的果报，对佛不敬，就要倒霉，这样看来，佛祖菩萨似乎有些胸襟狭窄、睚眦必报啊，对他不敬就要打击报复，这和官吏豪强不是一样了么？似乎并不能感觉到佛教宣称的“平等、仁善、淡泊、大度”之类呢。……
[你问得很好，如果你问这个问题的出发点不是为了要挑战，基本上你算是有思考的人。当然，什么“礼佛”有功德这种说法又怎么可能是佛陀教导的呢？那是后期的演变。回到佛陀时代，佛陀用尽一生来讲解世间的苦，也告诉了我们灭苦的方法，都是踏踏实实的，根本没有靠信仰来维持的。加上，佛陀时代根本就没有佛像，何来有人礼拜佛像？而且当佛陀说法的时候，人人都是静静聆听的，试试想象如果当时有人拿到一大堆香、花来“拜佛”，那不是很干扰大家听闻佛法吗？本来礼佛是出自一份感激老师的心，只是后来的人摆脱不了拜拜，就演变到你眼中看到的“佛教”，你说佛教是不是很无辜？当然我们也不要因此就直接毁掉佛像，因为也有很多人因为佛像的庄严而对这个伟大的老师起敬。]
基本上，如果你是有心要学习，你提出来的问题，是很好的问题，也是佛弟子应该思考的。不过你的问题有没有被解答，就要看你问对人吗？要是你问到的人对于佛教到底是怎么发展到今天也不清楚，那么就难堪啊。
但愿我所分享的，有帮助到你。如果有不明白的，我愿意补充。