39所985大学如下：
1、北京大学，签署协议时间：1998年5月。
2、清华大学，签署协议时间：1998年5月。
3、中国科学技术大学，签署协议时间：1999年7月。
4、南京大学，签署协议时间：1999年7月。
5、复旦大学，签署协议时间：1999年7月。
6、上海交通大学，签署协议时间：1999年7月。
7、西安交通大学，签署协议时间：1999年9月。
8、浙江大学，签署协议时间：1999年11月。
9、哈尔滨工业大学，签署协议时间：1999年11月。
10、北京理工大学，签署协议时间：2000年9月。
11、南开大学，签署协议时间：2000年12月。
12、天津大学，签署协议时间：2000年12月。
13、东南大学，签署协议时间：2001年2月。
14、武汉大学，签署协议时间：2001年2月。
15、华中科技大学，签署协议时间：2001年2月。
16、吉林大学，签署协议时间：2001年2月。
17、厦门大学，签署协议时间：2001年2月。
18、山东大学，签署协议时间：2001年2月。
19、中国海洋大学，签署协议时间：2001年2月。
20、湖南大学，签署协议时间：2001年2月。
21、中南大学，签署协议时间：2001年2月。
22、大连理工大学，签署协议时间：2001年8月。
23、北京航空航天大学，签署协议时间：2001年9月。
24、重庆大学，签署协议时间：2001年9月。
25、四川大学，签署协议时间：2001年9月。
26、电子科技大学，签署协议时间：2001年9月。
27、中山大学，签署协议时间：2001年10月。
28、华南理工大学，签署协议时间：2001年10月。
29、兰州大学，签署协议时间：2001年12月。
30、西北工业大学，签署协议时间：2002年1月。
31、东北大学，签署协议时间：2002年1月。
32、同济大学，签署协议时间：2002年6月。
33、北京师范大学，签署协议时间：2002年8月。
34、中国人民大学，签署协议时间：2003年9月。
35、中国农业大学，签署协议时间：2004年9月。
36、中国人民解放军国防科技大学，签署协议时间：二期。
37、中央民族大学，签署协议时间：二期。
38、华东师范大学，签署协议时间：二期。
39、西北农林科技大学，签署协议时间：二期。