各位牛人,去生物公司重测序,一般情况下,公司应该给客户反馈哪些信息?如何判断反馈的真假?

另外,测序质量如何评估?测序需要花费很多钱,因为怕被生物公司忽悠了,所以,希望对此有所了解的网友能给予回答,谢谢!

    反馈给你的信息会是一段序列,基因序列,比如“AATCGTA”之类的。

    要想知道质量高低,可以把已知序列的样品送去测,建议你一次多送几个样品,必须同一批样品,然后结果会反馈给你每个样品的序列,然后你找个比对软件做比对,如果一致性很好,那就说明质量高;如果比对结果很凌乱,那就说明一致性不好,测序不稳定。

    其实现在的测序技术都很成熟了,大的测序公司都不会差到哪里去;至于价格,其实个人觉得由于最近几年技术及设备提升造成的成本下降,其实已经真的不贵了,当然您要是想测通整个基因组,那就另当别论了,这里只说科研用测序。

    PS:本人分子生物学小硕一枚,毕业刚一年,也算是和分子克隆打了几年交道,如果有兴趣的话,欢迎讨论。

    PPS:希望能采纳,谢谢

追问

请问,已知序列的样品指的是跟所要测序的样品不同的样品吗?另外,我们是重测序,已经有了参考基因组。只是想通过重测序发掘一些有用的东西。重测序和未知序列的物种测序,公司反馈的信息一样吗?应该注意哪些问题啊?

追答

那咱们其实说的是一回事儿,如果你已经有了参考基因组,那序列你大部分都是已知的,这样的话只要用测序结果和你的已知序列作比对就可以看出一致性。

另外,不管是重测序还是未知序列测序,对于测序公司来说都是一样的,他反馈给你的都是基因序列,区别的是你自己的比对而已。
最后,测序是需要引物的,如果你已知序列,可以自己设计引物给测序公司;当然也可以让他们自己合成引物,但是这样时间相对会长一点,还得加上合成引物的时间。

温馨提示:答案为网友推荐,仅供参考
第1个回答  2013-08-21
这个,一个序列信息,一个图谱信息,生物公司一般不会忽悠的,但是也不乏懒惰之辈,费用的话,还可以吧,金斯瑞,宝生物都不错,金斯瑞便宜点,一个反应貌似8块钱,序列大小800bp左右吧,两端不怎么准,宝生物一个反应40,但是质量高,能达到1000bp的吧。测序质量的话,说白了,一分钱一分货,但是通常还可以
第2个回答  2013-08-22
lz貌似说的是高通量测序,ls两位回答的还是一代sanger法测序
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