食品健康证和非食品健康证有以下区别在于食品健康证是之主要从事食品加工和生产行业所用的，非食品健康证是指从事集体生活等其他行业或者是销售食品等行业的证件。
按照国家法律、法规的规定，从事食品、环境、劳动、放射、学校、药品生产经营的工作人员都必须定期进行健康查体，取得健康合格证后，方可上岗工作，就业、外出务工人员应当进行体格检查，建立健康档案，在校学生也应定期进行查体建立标准健康档案。
一、从事食品、环境、劳动、放射、学校、药品生产经营的工作人员，每年必须进行健康检查。
二、办理健康证明，必须本人到市疾控中心进行相关项目检查，检查合格后，方可办理健康证明。
三、未进行健康体检或健康检查不合格者均不予办理健康证明。
患有痢疾(阿米巴痢疾、细菌性痢疾)、伤寒、病毒性肝炎、活动性肺结核、化脓性皮肤病、渗出性皮肤病及接触性传染的皮肤病、重症沙眼、急性出血性结膜炎及其他有碍公共卫生的疾病的人不能领取健康证明。
扩展资料
健康证办理程序
体检地点: 当地疾病预防控制中心或经卫生行政部门审批承担预防性健康检查 的医疗卫生机构，未经批准擅自开展此项工作的，其出具的体检单卫生监督机构不予受理签发健康证。
1、对象：
从事食品、饮用水生产经营人员、化妆品生产人员、公共场所直接为顾客服务人员。凡患有痢疾、伤寒、病毒性肝炎等消化道传染病(不包括病原携带者)，活动性肺结核，化脓性或者渗出性皮肤病以及其他有碍食品卫生、公共卫生的疾病的，治愈前不得从事接触直接人口食品或直接为顾客服务的工作。
对从事食品生产经营的人员、生活饮用水的供、管水人员、化妆品生产企业生产人员；旅店、咖啡馆、酒吧、茶座、公共浴室、理发店、美容店、游泳场直接为顾客服务的人员每年体检一次。其他场所的直接为顾客服务的人员每两年体检一次。
2、主要检查项目：
病毒性肝炎、痢疾、伤寒、活动性肺结核、皮肤病、内外科常规、X光胸透、粪便细菌学培养（某些地区无此项）等。
3、体检和办证流程：
统一使用卫生部制定的《中华人民共和国预防性健康检查用表》，按照卫生监督机构确定的人员到健康体检单位进行预防性健康检查。
办理健康证前先进行健康查体。
1、带身份证和个人免冠一寸彩色照片2张，领取体检表到，收费处缴纳体检费，粘贴照片（另一张领健康证用）、填写好姓名、性别等基本情况。
2、检验室采血、大便肛拭化验。
3、内、外科常规体检。
4、x光胸透。
5、完成全部体检项目。
查体结果符合发放健康证条件的，查体结果不符合发放健康证条件的，不予办理健康证。经卫生监督机构组织的卫生法律法规知识培训合格后，将本人正面免冠彩色照片到所管辖的卫生局卫生监督所办理健康证明。
参考资料来源百度百科-健康证
健康证分以下几个类别
1、体检类别：
A类：饮食业、食品厂、饭堂、水厂、饮水机厂等从业人员体检。
B类：旅业、文化娱乐、美容美发、商场、化妆品厂、健康中心等从业人员体检
C类：一般工厂、企业普通职业招工体检
D类：电工、电梯工、锅炉工及其它高温、高空作业人员体检
E类：驾驶员年审体检
2、各体检类别体检项目：
A类体检项目：一般检查、内外科及五官检查、、ALT、粪便检查、胸透，以及血型（可选）、血常规（可选）。
B类检查项目：同A类。
C类检查项目：一般检查、内外科及五官检查、、ALT、胸透、血常规、血型（可选）
D类检查项目： C类体检项目＋心电图检查。
食品类的权限大于非食品类的。可以说食品类的审核是最严的，而且证件也较贵，主要是比其多了些检查项目。用食品类的证件同时可以从事其他行业，所以你如果从事涉及食品的工作，需要办理食品类的健康证。