1.级别不同
一般的公司企业，商务代表都是比医药代表的职务高，医药代表是商务代表的下设职位。也有一些企业中医药代表和商务代表的级别属于平行并置的关系。
2.工作内容不同
医药代表一般需要去医院与医生交涉，主要负责向医生介绍药品，推销药品等工作内容。
商务代表则是需要和医药公司打交道，负责公司产品的供货、回款以及该产品的招、投标等内容，客户一般是医药公司。
扩展资料：
医药代表的就业前景：
随着市场的逐步规范，企业对于医药营销人员的要求也越来越高，对于医药销售人员不仅在专业学历和相关经验上有要求，对其处事及解决问题的能力及方式也有相当高的要求。
在这样的环境下，高端营销人才如营销总监、区域经理、产品经理等职位，行业内部互挖墙脚的情况相当严重。除了研发和销售外，药企一些辅助部门的人才也非常匮乏，对于医药人才来说，药业求职前景充满光明。
而医药行业离职率一路走高，跟医药人才短缺不无关系。对此,中国药业人才网的指导专家指出，企业间人才高流动率的一个根本原因是从源头上缺少新鲜血液的输入。
目前,一些企业开始采取通过校园招募合格、有潜质的毕业生,然后进行培养的方式，来达到储备人才，缓解人才紧缺的目的。但这种做法远不能迅速改变医药行业后继无人的现状.。
所以综合来说医药代表的人才目前市场上有大量缺口，作为一个医药代表通过自己的努力前途也会很光明的。
商务代表的就业前景：
医药商务代表在现在社会中是公认的待遇比较高的职业。当然医药商务代表也具有大多说销售业务的共性：工资主要靠提成。
随着现在医药行业越来越规范，医药商务代表中存在的诟病也越来越多的被大家发现，当然这只是存在于部分医药代表中，不可以偏概全。
行业中对高学历，高素质，高阅历的医药商务代表的需求越来越盛，也使得这个行业越发紧俏，同时也是这个行业的门槛越来越高，以满足真正的商务代表的定义。
参考资料来源：百度百科-医药代表
参考资料来源：百度百科-医药商务代表