巫君玉的诊疗特色在于其深厚的中医温病造诣，专长于急性热病和消化系统疾病的治疗。他精于使用传统的经方，既尊重古人的经验，又敢于创新，汲取各派医术的精华。在慢性肝病的治疗中，他尤为擅长运用丹溪的气血痰火湿食六郁理论，采用独特的托毒生肌法来处理溃疡病，而对上消化道出血等病症，他则以大黄作为有效的治疗手段。
在临床实践中，巫君玉注重细致的诊断过程，强调通过四诊（望、闻、问、切）全面了解病情。他巧妙地运用力学和流变学的原理，将肌肤、血管和心搏的变化与脉象的变化相结合，从而更准确地解读病情。他的学术成果丰硕，包括《脉学今语》在内的多篇论文，如“溃疡病的诊疗”、“肝炎随谈”以及“五行的起源及其在内经中的运用”等，为中医理论的深入研究做出了贡献。
巫君玉的诊疗咨询涵盖了广泛的范围，他以中医药为基石，对现代疾病如皮肌炎、慢性溃疡性结肠炎、多发性硬化、慢性疲劳综合征、白塞氏病和慢性胰腺炎等疾病的治疗经验丰富，疗效显著，展现了他独特的中医诊疗智慧。
巫君玉，男，北京中医医院主任医师。历任北京市第六医院中医科主任、鼓楼中医医院院长、北京市卫生局副局长、北京第二医学院教授、北京中医学会副理事长、北京市第八届人大代表、中国中医药学会疑难病专业委员会主任委员等职。运用中医药治疗现代治病，如皮肌炎、慢性溃疡性结肠炎、多发性硬化、慢性疲劳综合征、白塞氏病、慢性胰腺炎等，经验丰富，疗效独特。