公务员编制是行政编制，是政府机关的正式人员。按照《国家公务员管理条例》规定，国家行政机构（即国务院、各级地方人民政府，以及国务院各职能部门、地方人民政府各职能管理机构）的行政编制人员实行公务员管理，国家权力机构、国家司法机关、党派组织、人民政治机构的人员参照实行公务员管理。事业单位一般不要求实行公务员管理，但也有个别事业单位参照实行公务员管理。
事业编制是辅助编制，事业编制按照财政来源又可分为全额事业编制、差额事业编制和自筹自支事业编制三种。全额编制即全额财政拨款事业编制，不允许也不能自主创收，完全靠财政拨款的单位，多指一些公益性事业单位和部分具有行政执法职能的事业单位，如：公办义务教育学校、防疫站、海事局、公办干休所、交通局下属交通稽查队、卫生局下属防疫站等等。差额事业编制，由财政进行差额拨款，待遇和收入在一定程度上挂钩，如：公立医院、公立大学、日报社等等。自筹自支事业编制，实际上与企业差不多，待遇和经营状况息息相关，多为一些服务型事业单位，如政府招待所、政府下属培训中心、从事应用性研究和开发的科研单位、政府直属印刷所等等，随着事业单位的改革将逐步改制成企业。
现在的政府机关有部分人是公务员编制，部分人是事业编制。公务员编制是要中央编制委审批才有的，一般单位名额都是固定的，除了每年报计划，公开招考公务员以外，不能随意增加。但是由于政府机关的业务量增加，又没有公务员编制，于是就招聘事业编制人员，在国家人事部不备案，不挂名，工资由单位自己或者地方财政供养。政府机关所属的事业单位，只有领导（副处以上或者少量正科）是公务员编制，其他人都是事业编制或者是合同工。
参考资料
http://www.gjgwy.org/201305/19640.html