法律分析：1、职位上的不同：法定代表人是企业的代表，是企业的负责人。实际控制人是企业的主要投资人或者间接但具体控制权的人。实际负责人可能只是一个挂名人物，不参与公司经营管理，公司实际上的管理者，就是实际负责人；2、义务上的不同：单位负责人是单位会计行为当然的责任主体,将有利于从根本上确保单位内部约束机制的健全、完整与有效。法定代表人是指依法代表法人行使民事权利，履行民事义务。实际控制人则是实际控制上市公司或其他组织；3、责任上的不同：法律规定单位负责人的具体责任形式,主要是发挥法律的威慑作用,促使单位负责人更好地贯彻落实《会计法》的各项规定,切实履行保证单位会计资料真实性和完整性的责任。
法律依据：《中华人民共和国公司法》 第十三条 公司法定代表人依照公司章程的规定，由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。公司法定代表人变更，应当办理变更登记。
《企业法人法定代表人登记管理规定》
第三条 企业法人的法定代表人（以下简称法定代表人）经企业登记机关核准登记，取得法定代表人资格。
第五条 企业法定代表人的产生、免职程序，应当符合法律、行政法规和企业法人组织章程的规定。
第九条 法定代表人应当在法律、行政法规和企业法人组织章程规定的职权范围内行使职权。