慢性化脓性中耳炎的病理变化呈现出多样性和复杂性。对于轻度患者，炎症主要局限于中鼓室的粘膜层，被称为单纯型。主要症状表现为鼓室粘膜的充血和水肿，伴有炎性细胞的浸润，渗出物主要由中性粒细胞构成。这些渗出物是初期炎症反应的表现。
然而，病情加重时，粘膜可能会出现增生和肥厚，若粘骨膜受损，炎症会深入骨质，影响听小骨、鼓窦周围、乳突甚至岩尖的骨质，形成慢性骨炎。在这种情况下，局部可能会生长肉芽或息肉，导致病情难以愈合，我们称之为骨疡型。
另外，当鼓膜边缘型穿孔或中耳粘膜遭受破坏后，如果炎症长期未能得到控制，局部可能会发生不寻常的生理变化。部分区域可能出现鳞状上皮化生，同时伴随着纤维组织的增生，形成特殊的胆脂瘤组织。这些组织可能与周围组织粘连，进一步导致硬化病变的发生，增加了治疗的难度。
慢性化脓性中耳炎(chronic suppurative otitis media)，是指中耳粘膜、骨膜或深达骨质的慢性化脓性炎症。本病在临床上较为常见，常以耳内间断或持续性流脓、鼓膜穿孔、听力下降为主要临床表现，严重时可引起颅内、颅外的并发症。