中共吉林省委党校的领导体制遵循《中国共产党党校工作暂行条例》的规定，实行校务委员会领导下的管理模式。该体制确保了党校工作的高效运行和决策的科学性。
现任的领导班子成员包括:
校长：巴音朝鲁，同时担任省委副书记和省政协主席，负责全面指导党校工作。
常务副校长（院长）李小平，主要负责校（院）的日常事务，同时兼任继续教育学院院长（应急管理培训中心主任）。
副校长（副院长）王志君，负责人事和党务工作，具体分管人事处、国际交流合作处、机关党委、工会等。
副校长（副院长）闫越，主要负责科研工作，包括科研处、经济与社会发展战略研究所等，并管理学术委员会和相关学术期刊。
副校长（副院长）周知民，专司教学工作，分管教务处、进修部、培训部等多个教研部，涵盖了广泛的教学领域。
副校长（副院长）程龙，负责学科建设、学位研究生教育和应急管理培训，管理研究生部和应急管理教研部等。
副校长（副院长）刘泉波，专注于后勤保障，包括财务、资产管理、物业管理等事务。
校委委员仲祝华，负责老干部、纪检监察工作，管理离退休人员和监察室。
校委委员郝舒，承担政务协调、安全保卫、信息管理和教学服务职责，具体负责办公室、保卫处和信息网络中心等。
校委委员刘长兴，则负责业务指导、对外宣传和教学辅助，管理业务指导处、图书馆以及相关出版社和学会等。
这样的组织结构确保了党校在各个方面的有序运行和职能分工，为提升党校的教学、研究和管理工作提供了坚实的基础。