首先要看大包方是建安企业还是中介公司，若是建安企业，你公司的税费由大包方代扣代缴。而你公司下手的分包方要自交税费了，因为税法不支持第三方转包。这样你公司的账务处理也较简单。
开票结算：
借：应收账款5000000
贷：工程结算5000000，税费按500万计提；
你可以凭分包方的建安发票加上自有开支处理你的成本。
若大包方是中介企业，你可以把你公司看作一包，（需要税务智慧）这样你的分包方就成了二包了，由你公司对二包税费代扣代缴；这样就避免了重复缴税。
开票结算：
借：应收账款5000000
贷：应付账款2000000
贷：工程结算3000000，税费分别计提；本公司税费借方科目是：工程税金及附加；分包方税费借方科目是：应付账款。
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