对慢性肾盂肾炎患者需做全面彻底检查，以明确：致病菌；单侧或双侧感染；原发病灶；肾实质损害范围及肾功能减损程度；有无尿路梗阻。首先应行尿液细菌和抗生素敏感试验，菌落计数每毫升尿液超过105个细菌可肯定为感染。慢性肾盂肾炎患者往往有贫血，除非急性发作时血液中白细胞数可升高外，一般正常。腹部平片可显示一侧或双侧肾脏较正常为小，同时发现有无尿路结石存在。静脉尿路造影可见肾盏扩张，肾实质变薄，有时显影较差，输尿管扩张。
逆行肾盂造影能显示上述变化。如行膀胱排尿造影，部分患者中可显示膀胱输尿管反流。膀胱镜检查可能发现在患侧输尿管口有炎症变化，输尿管导管受阻，静脉注射靛胭脂证实患肾功能减弱。放射性核素扫描可测定患肾的功能损害，显示患肾较正常小，动态扫描还可查出膀胱输尿管反流。