有机蔬菜生产基地应远离城区、工矿区、交通主干线、工业污染源、生活垃圾场等，距离公路主干线的垂直距离应不少于500米，而且地形开阔、阳光充足、通风良好，土壤pH值5.6—7.5。要求交通便利、地势平坦、水源充足、排灌方便。蔬菜生产的安全性与产地环境条件密切相关。良好的产地环境是实现蔬菜安全生产的前提。
蔬菜赖以生长发育的环境因素很多，但影响其质量安全的环境要素主要是空气、水分和土壤。环境质量评价是环境质量评价的依据。有机产品生产基地环境空气质量要符合GB3095-2012中的二级标准，生产灌溉水质要求应符合GB5084标准要求，土壤环境质量要符合GB15618-2008中的二级标准。
1.空气
有机蔬菜生产基地要远离废气，主风向上方无工业废气污染源，空气清新洁净，生产基地所在区域无酸雨。总悬浮颗粒物覆盖在植物叶面上，影响植物呼吸作用和光合作用，影响植物生长和品质，同时叶片可直接吸收粉尘中的有害物，造成蔬菜污染。蔬菜中的大部分品种对二氧化硫敏感，二氧化硫是大气中最常见的污染物，对各种植物都会造成轻重不同的损害。空气中的氟化物能够以气态形式通过植物叶面气孔进入植物体内，也可随颗粒物沉积到植物叶面上，多种蔬菜是对氟化物敏感的作物，受害后叶尖和叶缘坏死，使生长受到抑制，对结实也有不良影响。
2.灌溉水
有机蔬菜生产要求远离废水，保证有良好的灌排条件和清洁的灌溉水源，灌溉用水质量稳定达标，如用江、河、湖水灌溉，则要求水源达标、输水途中无污染。当灌溉水的pH<5.5时，土壤硝化细菌受到抑制，硝化作用减弱，氮肥得不到充分释放，磷酸盐的肥效降低，钙、镁等易遭淋失，这就是蔬菜作物在酸性条件下普遍存在缺氮、缺磷，尤其是缺钙和镁等微量元素的原因。同时，在偏酸条件下，土壤中的重金属毒物可溶性提高，易被蔬菜吸收致害。化学需氧量(COD)是水体中有机物含量的重要指标之一，灌溉水中的COD直接影响农作物的生长与结实。也有研究证明像菠菜、韭菜等蔬菜对汞有较强的富集能力，汞是对人和动物有蓄积作用的有毒金属元素，主要危害神经系统，会造成不可逆的危害。镉、砷、铬等有毒元素，以及某些铬化合物对人体都有着不同程度的损害，因此，灌溉水对于植物生长、结实和供人食用都至关重要。
3.土壤
有机蔬菜生产要远离废渣，要求土壤肥沃，有机质含量高，酸碱度适中，矿物质元素背景值在正常范围以内，无重金属、农药、化肥、石油类残留物、有害生物等污染。
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