山东菏泽音乐艺术学院北京分院的专业设置丰富多样，涵盖了艺术领域的多个方向，旨在提供全面的艺术教育。学院设有以下主要系别：
音乐系
声乐专业，包括美声唱法、民族唱法和通俗唱法，为学生提供了多元化的声乐训练。
器乐专业，包括西洋乐器如钢琴、吉他、小提琴等，以及民族乐器如二胡、琵琶等，满足不同音乐风格的学习需求。
表演专业，涉及影视表演、戏曲演唱、相声小品等，为学生提供全方位的表演技能培养。
音乐教育专业，针对中小学音乐教师，提供声乐、器乐、音乐理论和作曲等课程。
现代音乐专业，包含现代舞蹈、流行歌曲和音乐制作等内容，紧跟时代潮流。
舞蹈专业则设有中国古典舞、民族民间舞、现代舞等多种舞蹈形式，以及舞蹈编导和芭蕾舞等专业。
美术专业主要包括美术绘画、平面设计和艺术设计，培养学生的艺术创作能力。
此外，传媒类专业包括影视、播音与主持、摄影摄像和电视节目制作，培养学生在传媒行业的综合素养。