区别如下：
1.所处的空间不同。
高铁特等舱一般设置在紧邻列车车头，或者紧邻列车尾的地方，采用小空间密闭的布局。特等舱一般是采用一排1+2座位，一舱两排的结构。特等座是一等座的升级版。
商务舱一般位于第三节车厢，空间更大，采用一排1+1/2座位，一舱两排或者三排的布局。商务舱是特等舱的升级版。
2.座椅的舒适度不同。
高铁特等座是针织类座椅，向后倾斜的角度有限，只是比一等座宽敞一些。同时，特等舱没有独立卫生间和影音设施，感觉定位比较鸡肋。
高铁商务座是真皮蛋形座椅，包裹性和柔软度更好，可以平放至180°，方便躺卧，私密性好一些。商务舱有独立卫生间和影音设施。
3.乘客享受的服务不同。
乘坐高铁特等舱享受的服务与一等舱一样，只是乘客少，环境比较安静。而乘坐商务舱则有专人服务，可以单点咖啡，享受免费毛毯，在座位上独立点播娱乐节目。
特等座的票价是二等座的1.8倍，商务座是二等座的3.5倍。如果说特等舱是为商务人士服务的，则商务舱是为商界大佬服务的。