京东自营店和京东官方旗舰店是两个不同的概念。两者的不同主要是由于其商业模式不同而造成的。
一、京东自营，京东自营是京东公司自己经营的店面，京东自营就像是京东自己开了一个超市，这个超市中所有的产品都是它自己从厂家处购买，然后放到超市里去买。现实生活中就是京东从品牌厂家进货到京东仓库，然后在京东平台销售给消费者。
二、京东旗舰店并不是京东自己运营的店铺，而是各大品牌厂家利用京东这个平台，销售自家产品。就像有时在超市里，我们购买之后不需要在超市的收银台进行缴费，直接在商户中就能够消费。不过被京东列为旗舰店的商铺说明它真的是品牌厂商的店铺，不会出现假冒伪劣的情况。
三、京东自营与旗舰店并没有明显区别。京东自营全部采用自己的京东物流，有专门的京东小哥负责配送。一般购买京东自营的商品，第二天基本都能到货，有时候甚至当天就能送到。京东物流的特点就是配送快，效率高。而京东旗舰店一般还都是采用像顺丰、圆通、中通这样的快递公司发送商品。所以到货速度上一般没有京东自营那么快。这是京东自营的一大优势。
四、京东自营与旗舰店二者销售的产品是否有不一样呢？质量有没有差别？其实质量这方面整体而言，二者没有太大的区别，毕竟京东主打“只卖正品”理念，产品均为正品，产品源头都是从品牌厂商出发的，所以在质量这一点上大家可以比较放心。
综上所述，所以京东自营店与京东旗舰店都是比较靠谱的。
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