各种载体形式的文件材料在经过分类、整理、鉴定、组成保管单位、系统排列后，需要对位置进行固定，出现了“编目”。
地质资料的编目，就是通过一定形式，按照规定的要求，固定原本地质资料、成果地质资料、实物等地质资料在浩瀚资料海洋中存在顺序位置一项技术工作。除了固定位置外，目录还有揭示地质资料内容和成分的作用。地质资料编制的目录主要有：卷内目录、案卷目录、馆藏目录和地质资料馆藏简介等。
(一)保管单位的内清单
保管单位内的编目又称卷内目录，是在地质科技文件材料组成保管单位的基础上进行的。编目工作程序：
1.编页码
这里主要指原本地质资料的编目，成果地质资料自带页码，原本归档时地质科技文件材料有的没有编页码，要以件为单位按张编制页码，编制页码目的是固定位置和便于统计，及地质资料借用归还时便于检查是否缺页。
2.填写卷内目录
又称保管单位内清单，按国标要求，它的内容有：
件号，又称卷内序号作用是固定盒内文件材料位置。
责任者，指该件文件材料的作者或发文单位。
项目编号，是指国家项目、公司先导项目、公司科技项目等项目的编号或项目合同号、研究课题合同号。
资料题名，一般又称资料名称，该“件”文件材料有题名的，采用原题名。没有题名的需要准确拟定，要求能提示该“件”资料实质内容。
日期，是指该“件”文件材料形成日期，即材料首页标示日期。通常日期上有公章骑压。
页数，以件为单位的地质科技文件材料，填写“共几页”，以卷为单位的填写该卷资料所在页数起止页码。
备注是备用栏，可填写互见号(如原本与复制本的互见号，文字报告与另存于图柜的图件号，光盘在光盘柜中的位置号等)。
地质资料卷内目录 共 页，第 页
3.填写备考表
备考表放在该盒最后，主要说明该盒资料相关情况。如完整程度、后来资料补充情况、电子文本光盘存贮情况等。单井资料时常隔几年会有二次测井、二次测试、地震磁带的磁带号等。
备考表最后还有填写人、审核人和填写日期等栏目。
原始地质资料备考表
4.成果资料借阅去向表
成果地质资料一般不在盒内放置备考表，但设置盒内“资料借阅去向表”。资料借阅去向表是由借阅资料人填写的，由借阅日期、借阅单位、借阅资料件号、资料名称、借阅人签字、归还日期和备注栏组成。它与地质资料数据库管理系统中的借阅栏目设置一致，资料管理人员通过资料借阅去向表或数据库管理系统中的借阅栏目浏览，了解资料去向和借出时间，以方便摧还和提高资料利用周转效率。
（档号）成果资料借阅去向表
5.填写资料盒封面
地质资料馆一般都有定制的资料盒，封面上有固定的文字模板或格式，它是用于简要提示全宗单位和盒内地质资料成分或内容的。所以填写要求简要、清楚、准确。封面填写的主要内容有：
第一，全宗单位名称，处于封面上部。如“中国有色勘探开发研究院”、“中国石油大庆油田”等。
第二，资料盒的规格，执行国家档案盒标准，只是不用“档案盒”字样。常常添加更加贴切的“原本地质资料盒”、“成果地质资料盒”字样。
第三，案卷标题。是用以概括地反映盒内资料主要内容与成分的。它一般由三部分组成：项目(课题或井)名、盒内资料主题、资料文种。例：“苏北盆地溱潼区块油气地质储量研究报告”、“××××区块地球物理勘探二维数据处理报告”、“加蓬国GBB区块Y26井录井地质报告”等。
第四，编制日期。指案卷内主报告编写落款时间，单井资料因为录井、测井、测试、化验分析等报告完成时间是一个时间段，由不同单位先后分别完成，所以填写起止日期。
第五，保管期限与密级。如实填写：永久、五年、三年等；秘密、机密、绝密、企业秘密、内部资料等。没有密级或没有确定保管期限的可暂不填写。
第六，档号，是档案和地质资料管理过程中必需编制的固定序号。其基本作用是固定位置，便于检索和归位，利于统计。
通常在地质资料管理中使用的有全宗号、分类号、案卷号、件号组成。原本地质资料、成果地质资料、实物地质资料、地震磁带等数据体资料的档号编制和组合方法不尽相同。
原本地质资料的档号编制，随档案管理中档号编制方法。由全宗号、分类号、案卷号、件号组成。
成果地质资料的档号编制，以方便利用和便于存取为原则，与原本地质资料的档号略有不同，由全宗号、分类号、案卷号、套号、件号组成。
在企业地质资料馆，全宗号作用不可小视，企业从外单位收集来的、与兄弟单位交换来的、接收其他单位分发来的等资料，都可列入不同全宗在成果资料中归档，并提供客户利用。成果地质资料还多出来一个“套号”，同样的资料在原本资料中仅需归一套，而成果资料为提供利用而归档多套，套号用以区别“是此套而非彼套”。例：井235档成果资料归档5套供地质科技人员阅读和利用，可标注A、B、C、D、E以区分，井235A、井235B ……，或井235(1/5)、井235(2/5)……。另外还有册序号。例：开256档成果资料是一份开发方案，有五个保管单位或称五盒，按卷内目录排列，设五个册序号又称盒号。
盒外侧标签
实物资料档号，通常分岩心、岩屑、标本分别设置。通常由箱号、回次号、块号、包号等构成。
小型资料室大多保存的是自己单位所形成的地质资料，其档号只填写分类号、案卷号、件号即可；而在较大的资料室或地质资料馆就会用到全宗号，因为一个地质资料馆通常保存的并不是单一的全宗，其馆藏往往由是由很多的全宗组合而成，所以除了分类号、卷号、件号外必须加上全宗号以区分。
全宗号，地质档案(资料)馆指定给立档单位的编号。一般用阿拉伯数字表示。
分类号，是本单位全宗内部的地质资料分类，指定给地质资料的类属符号＋序号。可以用汉语拼音字母或汉字＋阿拉伯数字组合表示。如用“K.03”或“开03”表示开发类也是第3序类。表示该类资料为开发类，同时是排列为第3序类位置。
案卷号，类内案卷排列的顺序号。如“K.03-0066”档，标示该案卷为开发类第66卷，是原本地质资料开发类的册序号。它反映的是实体地质资料案卷在馆藏中的某类地质资料案卷的序号。案卷号完全以阿拉伯数字表示序位。
件号，案卷内以件为单位的排列顺序号。它反映的是实体资料在该卷中的所处顺序位置和该卷中地质资料“件”的序号。用阿拉伯数字表示。件号可不在资料盒面显示。但在件的首页归档章或归档标签中显示：
件首页标签
根据归档章和归档标签中的标识，用于识别该件资料是哪个地质资料馆的资料，属于该地质资料馆中哪一类的哪一盒的资料，及此件资料在该盒中的排序位置。条形码配合条形码扫描技术，用于数据库管理系统中替代借阅登记功能，它以件为单位，在海量资料中具有唯一性。
归档章和归档标签的作用是便于人工识别借出资料的归位。
原本资料档号的结构：全宗号—分类号—案卷号—件号。
地质勘探类档号示例
光盘编号又称载体序号，是光盘独立存放在光盘柜中的位置顺序号。如果存放电子文本的光盘随纸质文本存放在光盘册中，而光盘册与纸质文本一起排列存放时，则光盘在卷内目录中体现以件而编制件号，作为这盒资料中的一件而存在。一般无须再编制光盘号，仅在光盘上标明件号。光盘集中存放于光盘柜，必须编制光盘号。光盘号标注在光盘盒背面的外标签上。
原始资料光盘的标签
档号标签，是贴于档案资料盒脊处的标识，有全宗号、分类号、盒号、起止件号、题名等内容。目前已有计算机系统自动生成并打印在标准标签上，粘贴于盒脊处。
盒脊标签
以原本地质资料为例，对盒脊标签内容解释：全宗号12345，表示地质资料馆给予该立档单位的全宗编号为12345；分类号“井”表示该档资料为单井类资料，在单井资料中，该单井序号为123；案卷号267，在原本井资料中，案卷号是该案卷在单“井”所有原本案卷(盒)顺序号267，起定位作用。案卷号是连续编号的，中间没有空缺。如某地质资料馆，单井资料共123口井，分类的单井档号只有123个号，而案卷号就按案卷多少来编顺序号，这123口单井中，案卷或称“保管单位”会远远地超过123这一数字。
在成果类中，全宗号、分类号解释与原本地质资料相同，案卷号可改设为册序号(假设册序号05)，表示第123档单井资料中，该盒资料为第5盒；成果资料编册序号，就这一口井有多少盒成果资料就几个盒号，表示在这口井成果资料中的册序。
有的馆藏单位还会在成果地质资料盒脊处标注案卷名，目的是为了方便在库房中寻找时直接浏览和归位，成果资料编号中还存在“套号”，如某口井共归档5套成果资料供借阅，分别标注A、B、C、D、E套，区别其是此套而非彼套，已在相关章节予以介绍。
一片光盘有时只存一档电子文件，打开光盘，首先看到的是该档全套电子文件目录，有时又称盘内目录，类似于纸质卷内目录。
原始资料光盘文件目录
有时光盘容量大，或是移动硬盘，盘内可分一级、二级目录，以档为单位的是一级目录，类似于案卷目录，下设的二级目录是文件目录。
原始电子资料目录
(二)编制地质资料案卷目录
是以保管单位为对象进行登记并编制的目录，也称保管单位名册。分为：原本地质资料案卷目录、成果地质资料案卷目录、电子目录清单、磁带目录清单、岩心(岩屑)目录清单、缩微胶卷目录清单等。它是馆藏机构的地质资料的资产账。在地质资料管理工作中发挥着基础性作用。它是馆藏地质资料管理秩序的真实记录和书面账册，是地质资料人工检索利用的主要工具，是地质资料统计、检查、清理工作的基础。也是数据库系统编制和数据维护与管理的依据。
1.案卷目录的编制基础
案卷目录的编制以地质资料馆室的馆藏案卷为基础，它应该显示出一个全宗单位地质资料馆藏实际案卷存在的秩序状况。目录编制时应遵守资料卷、盒的排列顺序录入。忠实地反映资料卷、盒排列体系。它有着固定卷、盒秩序和资料卷址的“门牌号”作用。是在数据库系统检索到目录号后找到实体资料的依据。由于该目录是统计馆藏资料的依据，所以地质资料管理人员有时形象地称其为“账簿”。
根据地质资料目录编制实践，案卷目录编制分统编和分编两种。统编，指在一个全宗内只有一本的“账”，统编目录中条目之和即为全宗内馆藏总量；分编，是指在一个全宗内按类分编有几本并列的帐，各分编目录中条目总和反映出全宗馆藏卷册总量。地质资料案卷目录，通常采用分编方法，分别是原始地质资料案卷目录、成果地质资料目录、磁带目录和实物地质资料、缩微胶卷等目录。其中原始地质资料、成果地质资料还可分解为“矿产勘探册、矿产开发册、单井册、理论研究册等”。按载体分，有纸质资料目录、电子目录、实物资料册、磁带目录册等。如果一个资料室内所有馆藏都是原始地质资料(又称地质档案室)的，可采取统编方法，只设一本案卷目录账簿，从序号“1”开始编起。采取案卷目录分编方法时，每一类一个分册，分册编独立排序，分别从序号“1”开始编起。
2.目录编制的形式与结构
案卷目录的几种类型：
簿册式目录，除封面、扉页、目次页、案卷目录编制说明外，主要内容是目录表。
封面，由目录名称、编制单位、编制时间构成，扉页中的内容，除了目录名称、编制单位和编制日期外，还应有全宗号、目录册号、主编人员、领导签批，并盖有编制单位印章。目录名称一般由全宗单位名称加目录标题，目录标题由目录类别、期限、密级和“案卷目录”四个词组构成。
目录主表的结构例示：
××××地质资料馆原本资料案卷目录（单井册）
××××地质资料馆原本资料案卷目录（物探册）
以上第一、二节是对地质资料后期整理通用部分的叙述和总的要求，下面按纸质资料(原本、成果)、磁质资料、实物资料分述，分别针对各种载体不同特点提出后期整理要求。