金鱼的品系大体可分为草种、文种、龙种、蛋种和龙背种五大类。
草种金鱼：又称金鲫种。它是金鱼的祖先，外观体形似鲫鱼，身体扁平纺锤形，背鳍正常，尾鳍单一。特征：体形近似鲫鱼，具背鳍，尾鳍叉形，单叶。草金鱼的尾鳍有长尾和短尾之分，短尾者一般称草金鱼；长尾者称长尾草金鱼或称燕尾(国有些品种的尾鳍和家燕的尾羽相似，因此得名)。英、美等地称“彗星”。发现金鲫鱼最早的时间，约在晋朝(265年一420年)。
文种金鱼：一般身体较短，各鳍较长，又背鳍，尾鳍分叉为四；眼球平直不突出。名贵品种有鹤顶红、珍珠等。特征：有背鳍；尾鳍双叶；身体有短宽形或长形(似鲫鱼)。 较早记载双尾金鱼的史料是陈善(1579年)，《万历杭州府志》“……又取虾与鱼感则鱼尾酷类于虾。有三尾者，五尾者，此皆近时好事者所为，弘正间盖无之，亦足觇世变矣。”按照这条史料，明朝在弘治和正德时(公元1488—1521年)还没有双尾金鱼，所以双尾金鱼是在公元1521年后，到1579年前培育出来的。双臀、长鳍的出现比较迟些。《万历杭州府志》作者陈善，对杂交还有一些误解，认为鱼、虾杂交后，才产生了像虾尾似的双尾金鱼。
龙种金鱼：外形与文种相似，不同处为眼球凸出于眼眶外。自古以来视龙种为金鱼正宗。
龙种金鱼有50多个品种，名贵品种有风尾龙睛、黑龙睛、喜鹊龙睛、玛瑙眼、葡萄眼、灯泡眼等。 特征是：体形粗短，头平而宽，各鳍发达；眼球形状各异，有圆球形、梨形、圆筒形及葡萄形，膨大突出眼眶之外，鳞圆而大；臀鳍和尾鳍都成双而伸长，尾鳍四叶，胸鳍呈三角形，背鳍高耸。
蛋种金鱼：外形与鲫鱼有较大差异。体短而肥，眼球不凸出，背部平直无背鳍。名贵品种有红蛋、绒球蛋、凤蛋、水泡眼、兰寿等。特征：无背鳍，体形缩短，圆似鸭蛋。尾鳍有长尾和短尾两种类型，短尾者称“蛋”，长尾者称“丹凤”，其它各鳍均短小。高品质的蛋种金鱼，背部圆滑，呈弧形，最高点在背脊的中央。
龙背种金鱼：外形与蛋种相似，不同处为眼球凸出于眼眶外。名贵品种有朝天龙、龙背、龙背灯泡眼、虎头龙背灯泡眼、蛤蟆头等。 特征： 龙背种分七型，尾短为龙背型，头顶具肉瘤为虎头龙背型，鼻膜发达形成双绒球为龙背球型，头呈三角形为蛤蟆头型，眼向上生长为朝天龙型，鳃盖翻转生长为龙背翻鳃型，角膜凸出为龙背灯泡眼型。
它是中国金鱼中的“元老”，是当代金鱼中最大的一个系列品种。它的体形有长、短之分，以短、粗、圆为多见。头型也有尖、宽两种，鳞片现有软、硬及珠鳞状三种，腹部短宽或臌圆，眼小平直，不凸于眼眶外，有背鳍和长有四开大、小两种尾鳍，形状像“文”字，因而得名。它的体色多数为红、红黑、红白、蓝色、紫色、银白色、黑色、五花斑及透明玉白色等。主要代表品种如：文鱼、高头（古名：堆肉）、绒球、珍珠鳞、鹤顶红、狮子头、琉金[1]等。
龙种
又称龙睛，它是中国金鱼中的代表。体形短粗，有背鳍，其眼球形状可分：棋子型、苹果型、灯泡型三种。四开大尾鳍，头平而宽，两眼球突出眼眶外，形如龙睛故名。体色常见的有红、白、墨色、蓝色、紫色、红白花、五花等。主要品种如：红龙睛、白龙睛、墨龙睛、蓝龙睛、紫龙睛、红白花龙睛、鹤顶龙睛、蝶尾龙睛等。详情
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中国金鱼依其头部、身体、尾鳍，以及有否背鳍等特征区分为四种品系，分别是鲫系金鱼、文系金鱼、龙系金鱼和蛋系金鱼。
金鲫
鲫系金鱼（草种）最原始的金鱼品种，形状与普通鲫鱼相似。主要特征是身体狭长呈流线型、小眼睛、单尾鳍、游动很快但不怕人。经长期驯养后，能随着人的呼叫声列队而游，投喂食物时常常群集水中争食。依据色泽的不同，分为白草鲫、金鲫、墨黑鲫、黄黑鲫、红白鲫等品种。
红狮头
文系金鱼（文种）特点是体型短、头嘴尖、腹圆、眼小而平直，不凸于眼眶外。有背鳍并长有四开大尾鳍，犹如“文”字，所以得名“文种”。文系金鱼体色多为红、红黑、红白、蓝色、紫色及五色花斑等。主要品种有文鱼、狮头和珍珠鳞等。
黑龙睛
龙系金鱼（龙种）
龙睛鱼是龙系金鱼的代表种。它体型短粗，有背鳍，四开大尾鳍，头平而宽。两眼球突出眼眶外，所以得名“龙睛”。体色常见有红色、白色、墨色、红白花、五色花斑等。主要品种有：红龙睛、白龙睛、黑龙睛、红白花龙睛、蓝龙睛、紫龙睛、龙睛高头、红帽子龙睛等。
水泡朝天
蛋系金鱼（蛋种）蛋种鱼的特征是无背鳍、身体肥短呈蛋形。它的尾分四开，有长短之分，头平而宽，眼平直不突出，或形成水泡眼。体色常见的有红、白、五色花斑等。主要品种有蛋鱼、蛋凤、寿星、水泡眼、朝天眼等。
几大主要品种：一、文种（文金）
文种(文金)，该品种是中国金鱼最古老的一种，体形比鲫鱼大为缩短，鳍比龙睛稍宽，鳍部发达，头有宽、窄两类，从上俯视，鱼体犹如“文”字，故名；总之，由来已久，先后出现七十余种，其中名种颇多。
二、蛋种（蛋金)
蛋种(蛋金)：体形短缩，圆似鸭蛋，早在公元1780年已将此类鱼称作“鸭蛋鱼”。背上无鳍，其他各鳍也很短小，此类中长鳍的被取名为“蛋凤”，大概是取其尾长似凤凰形之意。眼平直，不凸出于眼眶外。此类金鱼的生命力强于龙种、文种，生长速度快，过去曾最多出现过七十六个品种，故此类中包含的名种较多。
三、龙种（龙金）
龙种(龙金)：龙睛又名龙眼、凸眼，自古以来就被当作金鱼的正宗，日本称之为“中国金鱼”。在明代宣宗皇帝朱瞻基御笔所画的《鱼藻图》中就有眼球凸出的金鱼，说明由来已久。1895年从广东经横滨传入日本。龙睛体形短，眼球发达，凸出于眼眶外，类似古代传说中龙的眼睛，其形状多样，如圆球、梨形、圆筒形以及葡萄形等等，眼球大约在孵化后一个月即逐渐开始凸出，而最后形成要在两、三个月后，因品种不同，迟早不一。龙睛的色彩较为丰富。
四、金鲫种(草金)
金鲫种(草金)
五、龙背种
龙背种，是按新的分类原则另立的一类，虽然目前出现的品种不多，但通过杂交，新的品种将会不断产生，已出现过的有三十七种。
种类：1、草种鱼
草种鱼体型近似鲫鱼，是金鱼中最古老的一种，身体侧扁呈纺锤形，有背鳍，胸鳍呈三角形，长而尖。因其野性略存，有跳缸的危险，故鱼至新环境后头两天要有防护措施。
2、龙种鱼
龙种鱼是金鱼的代表品种，也是主要品种。其主要特征是体短，头平而宽，眼球膨大突出眼眶之外，似龙眼；鳞片圆而大，胸鳍长而尖呈三角形，尾鳍四叶。
3、文种鱼
文种鱼的主要特征是体短而圆，头平而窄，嘴尖，眼小，大尾，尾鳍叉多在四叶以上。体色多为红、红白、紫、蓝黄、五色杂斑等。高头(北方称“帽子”)和珍珠是其代表种。高头体短而圆，头宽，头顶上生长着草莓状肉瘤，从其肉瘤的生长部位和发达程度还可以分为鹅头型高头和狮头型高头两种类型。前者的肉瘤仅限于头项范围；后者的肉瘤还延伸到两颊颚。依其主要品种的形态特征可以分为很多种。 珍珠鱼又称为珍珠鳞，其鳞粒粒如珠，故得名。珍珠鱼有球型、橄榄型两类，还有大尾和短尾之区别。
4、、蛋种鱼
蛋种鱼的主要特征是体短而肥，形如鸭蛋，无背鳍。有成双的尾鳍和臀鳍。鳍的长、短和形状差异较大。一般绒球、水泡、虎头等的鳍短小而圆；丹凤、翻鳃、红头等的鳍较长大