无水箱马桶的弊端主要有以下几个方面：
1、无水箱马桶的水压冲击力度小，因为无水箱马桶是没有储水箱的，它冲水是来自于自来水，所以导致它的冲水力度小，很多时候会冲不干净。
2、无水箱马桶是一款智能马桶，它的使用范围比较小，只适用于有城区自来水系统的地区，还没有全部广泛使用。
无水箱节水马桶只能给少部分的卫生间使用。自来水的压力不能太高或太低，还会导致管道堵塞的问题，只能慎用。技术上没问题，但是适应面就有限制了。水压低的不行，管道径小的不行，水质差的不行(延时阀时间长了会弹不起来)等。这些限制了这个形式马桶的发展。
3、因为没有储水箱，如果该地区停水的话，那无水箱马桶就不能冲水了，比较麻烦。
4、无水箱智能马桶的加热功率相对较小。