1．目的不同。行政处罚着眼于制止和预防违法行为的发生，即通过科加额外义务或限制权利的方式以实现一般预防和特殊预防，而民事处罚则着眼于对受害人的补偿或被损害权益的恢复。
2．方式不同。按照《行政处罚法》的规定，行政处罚的方式主要有警告、罚款、责令停产停业，暂扣或者吊销许可证、执照，没收违法所得，行政拘留等；根据《民法通则》的规定，民事处罚的方式有十种：停止侵害、排除妨碍、消除危险、返还财产、恢复原状、修复重作更换、赔偿损失、消除影响、恢复名誉、赔礼道歉。
3．原则不同。行政处罚主要根据违法行为的社会危害程度决定，违法行为受到的惩罚应与其对社会的危害程度相一致；而民事处罚则以恢复原状和等价赔偿为原则，赔偿数额一般与他人受到的损失相当。
4．程序不同。科处行政处罚遵循行政处罚程序；而民事处罚则须执行民事诉讼程序，以行政裁决的方式追究民事责任的，须遵循司法程序。
5．转继性质不同。行政处罚责任只能由违反行政法上的义务人承担，既不能替代，也不能转继以及承担连带责任；而民事责任从保护受害人的利益考虑，规定在某些情况下由一个民事主体（不一定是违法行为人）先承担，再追偿。