物流公司归交通运输管理部门管。
详细解释如下：
物流公司主要从事货物运输和物流服务，在我国，这类公司的运营需要遵守相关法律法规，接受政府部门的监管。交通运输管理部门是负责监管物流公司的主要机构。它们负责确保物流公司的运营符合国家和地方的相关法律法规，保障物流市场的公平竞争，确保物流行业的健康有序发展。此外，交通运输管理部门还负责监督物流公司的服务质量，处理相关的投诉和纠纷，确保消费者的合法权益得到保障。物流公司需要遵守交通运输管理部门制定的各项规定，包括安全标准、服务标准等，以确保物流行业的整体效率和安全性。
具体的管理内容和标准可能会因地区和国家的不同而有所差异，但总体目标都是为了促进物流行业的健康、有序发展。