在起初的一二百年间，基督教是作为异教被政府（
罗马帝国）禁止的，基督教信徒受到迫害，甚至被处死。直到313年，罗马帝国皇帝
君士坦丁大帝颁布米兰诏书，从而使基督教成为政府所允许的宗教。325年，尼西亚信经在第一次尼西亚公会议上通过，并成为基督教的最基础的原则，现在几乎所有的基督教教派都接受这一原则。392年，罗马皇帝狄奥多西一世宣布基督教为国教。从此，基督教开始迅速发展起来。395年，罗马帝国在内部矛盾和外族入侵下分裂为东罗马和西罗马，基督教也开始分裂为
东正教（自称正教）和罗马公教（自称公教），两个教派都自称是基督教的正统。罗马教皇（教宗）是罗马公教最高领导者，而君士坦丁堡牧首则是东正教的首领。到1054年，东部教会和西部教会互相宣布把对方宗主教驱逐出教，标志着罗马公教和东正教正式分道扬镳，称为
基督宗教大分裂。公元7世纪伊斯兰教兴起，
耶路撒冷落入穆斯林的控制之下。西罗马地区的教会和国家为解放圣地耶路撒冷在1095年－1291年间先后八次
十字军东征。16世纪，德国、瑞士、荷兰、北欧和英国等地发生了宗教改革运动，它产生出脱离天主教会的基督教新教教会。领导人物是马丁·路德、加尔文等人，他们建立了新教和圣公会，脱离了罗马天主教。中国所称的“基督教”，基本上都是这个时候产生的新教。