南和一中是指南和县第一中学，其涉嫌违纪的问题主要有两个方面。
南和一中该校违反了“三重一大”制度，即重大事项决策、重要干部任免、重要项目安排、大额资金使用，未按照规定程序经集体讨论决定，而是由个人擅自决定。这种行为严重违反了党的纪律，破坏了民主集中制原则，导致了学校资源配置的不合理和国有资产的损失。
南和一中的原校长段耀全还存在其他违纪问题，包括违反廉洁纪律，违规收受礼品、礼金；违反群众纪律，在管理、服务活动中违反有关规定收取费用；违反工作纪律，不正确履行职责，违规向学生收取费用。这些行为严重损害了学校的形象和声誉，也侵害了学生的权益。
南和一中的问题不仅仅是个别领导干部的问题，更是整个学校管理体制的问题。必须加强党风廉政建设和反腐败斗争，严肃查处违纪违法行为，坚决铲除腐败现象的根源。同时，也要加强学校内部管理，完善规章制度，提高领导干部的素质和能力，确保学校健康有序发展。
涉嫌违纪的处理方法：
1、立案调查：对南和一中涉嫌违纪的问题进行立案调查，查明事实真相，收集相关证据。
2、严肃处理：根据调查结果，对涉嫌违纪的人员进行严肃处理，依法依规给予相应的纪律处分或移送司法机关处理。
3、追责问责：对负有领导责任和管理责任的相关人员进行追责问责，要求其承担相应的责任。
4、加强监管：加强对南和一中的监管力度，完善学校内部管理制度，确保学校健康有序发展。
5、公开透明：对处理结果进行公开透明，接受社会监督，维护公平正义。
6、廉政教育：对南和一中的全体师生进行廉政教育，增强他们的廉洁自律意识，预防类似问题的再次发生。
7、整改落实：对南和一中存在的问题进行全面整改，落实各项整改措施，确保学校管理规范、有序。
8、完善制度：进一步完善南和一中的各项制度，强化制度执行力度，确保制度的严肃性和权威性。
9、建立长效机制：建立南和一中反腐倡廉的长效机制，加强内部监督，完善风险防范措施，从根本上杜绝违纪问题的发生。
10、加强合作：加强与相关部门和机构的合作，共同推进南和一中的党风廉政建设和反腐败工作，形成工作合力。