1、发货类型
官方旗舰店是货已经清关进入国内了，海外旗舰店是货还没有清关需要国外或者保税仓发货。
2、产品归属
海外旗舰店的货和销售额不属于中国区，是属于海外总部的。而旗舰店一般只针对国内的产品，无论货还是销售额都是属于中国区域的。
3、店铺定位
海外旗舰店是商家均为中国大陆以外的公司实体，具有海外零售资质；销售的商品均原产于或销售于海外,产品是由国外直运到中国保税区，由海关监管直发也叫做海外直购。
旗舰店是品牌的持有者/持有公司自己开的商城店。
4、监管机构
国内官方旗舰店是在国内注册销售，在中国分公司二次包装，加贴中文标签并设立防伪码。海外官方旗舰店是在海外注册的分公司，直接从美国工厂直运到中国保税区，由海关监管直发，犹如从美国市场直接送到你的手中，除了海外清关之外没有任何多余中间环节，由海关机构监管。
扩展资料：
要注明的是，旗舰店和官方旗舰店这类的称呼都不重要，重要的是官方承不承认。
首先来看一下海外旗舰店的常规的两种形式。第一种是以集团、公司、百货以及购物网站为主的一个海外旗舰店，比如cosme海外旗舰店，sasa莎莎海外旗舰店、屈臣氏海外旗舰店等。
如果是在这类的店铺海外旗舰店买的话，主要还是看所在店铺本身靠不靠谱。海外旗舰店和海外旗舰店之间也是有选择的，建议选择一些名气比较大的，大家普遍知道的一些店铺的海外旗舰店。
主要是因为这些店容易辨认，相对收集信息也比较容易，可以很快也很容易得去搜寻它的真假。
第二就是品牌方自身的海外旗舰店。
这个就比较常见了，比如丽得姿海外旗舰店、美迪惠尔海外旗舰店等。其实这只是发货形式的不同。一个是保税仓，还有一个就是海外直邮。
先来说一下保税仓。
保税仓是比较常见的一种发货的形式。比如canmake是一个日本牌子，但是发货地在香港。这个其实是很正常的，不要被发货地误导了，因为品牌会将产品集中在保税仓，方便发货和管理。保税仓就把它单纯理解成一个储藏的仓库就可以了。
还有一个就是海外直邮。
比如松本清海外旗舰店，就同时有保税仓和日本直邮两种形式。其实差距不大，一个是先统一运到保税仓放着在从保税仓发出，还有一种是直接从日本发货。所以，海外旗舰店的真假和产品的发货地是没有什么必然的联系的。
参考资料来源：百度百科-旗舰店