能。二级建造师考过了两个专业，考生可以不注册主项专业，只注册增项专业，但是不可以主项和增项注册在不同公司，二建增鲜和主项专业必须要注册在同一家单位，或者只注册一个专业。
二建增项和主项可以只注册增项，不注册主项，二级建造师注册规定，如果二级建造师取得多个专业证书的，多个专业都只能注册在同一家单位，不可以分开注册在不同公司。
二级建造师可以只注册增项，比如你有建筑工程的主项资格，机电工程的增项资格，你可以拿机电工程的资格证书去注册，而不注册建筑工程专业。
二级建造师注册规定：
受聘于一个具有建设工程勘察、设计、施工、监理、招标代理、造价咨询资质的企业。
申请人有下列情形之一的，不予注册：
(一)不具有完全民事行为能力的;
(二)申请在两个或者两个以上单位注册的;
(三)未达到注册建造师继续教育要求的;
(四)受到刑事处罚，刑事处罚尚未执行完毕的;
(五)因执业活动受到刑事处罚，自刑事处罚执行完毕之日起至申请注册之日止不满5年的;
(六)因前项规定以外的原因受到刑事处罚，自处罚决定之日起至申请注册之日止不满3年的;
(七)被吊销注册证书，自处罚决定之日起至申请注册之日止不满2年的;
(八)在申请注册之日前3年内担任项目经理期间，所负责项目发生过重大质量和安全事故的;
(九)申请人的聘用单位不符合注册单位要求的;
(十)年龄超过65周岁的;
(十一)法律、法规规定不予注册的其他情形。
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