与上铺室友共处一室时，遇到上铺室友鞋子味道不好闻的情况，可以尝试以下委婉的方式来提醒他：
使用温和的语气：在与上铺室友交流时，使用温和的语气，表达自己的感受，避免使用过于直接或冒犯的措辞。
私下交流：选择一个合适的时机，在私下与上铺室友交流，避免在公共场合或有其他人在场时提及此事，以免尴尬。
表达关注：表达对上铺室友的关心和关注，例如说：“我注意到最近有一点异味，你是否有注意到？我担心这可能会对我们的居住环境产生一些影响。”
提供帮助：主动提供一些解决问题的建议，例如：“也许我们可以一起寻找一些方法来减轻鞋子的气味，比如使用除臭剂或定期清洗鞋子。”
引导自我意识：可以尝试引导上铺室友对自己的鞋子味道产生一些自我意识，例如说：“有时候我们可能不太容易察觉到自己的味道，你是否尝试过使用除臭剂或保持鞋子的清洁呢？”
提醒共同责任：强调共同居住的责任，例如说：“作为室友，我们共同享有一个舒适的居住环境，让我们一起努力解决这个问题，使我们的宿舍更加宜居。”
尊重个人隐私：在提醒上铺室友时，尽量避免直接指出他的鞋子有异味，而是侧面提及气味，以尊重他的个人隐私。
请注意，委婉地提醒上铺室友鞋子味道的目的是为了改善居住环境，因此在交流时要保持友善和理解的态度。