肿瘤突变负荷（TMB）：免疫治疗的潜在金钥匙
TMB，即肿瘤基因组中非同义突变的数量或密度（每兆碱基对中的突变数），它作为一种替代的新抗原负荷指标，曾以全外显子组测序（WES）作为权威标准进行评估。然而，随着高通量测序（NGS）技术的发展，特别是大panel检测的广泛应用，TMB在预测免疫治疗疗效上的作用愈发显著。
共识与最佳实践
深度与覆盖范围: 一个可靠的TMB检测需覆盖至少1Mb的编码区域（相当于300多个基因的全外显子），且最低测序深度需达到500×。对于靶向测序panel，应确保检测到影响蛋白质编码的体细胞突变，至少检出频率5%的突变，以保证TMB值的准确性和稳定性。
平台和算法一致性: 不同平台、大小的panel或分析方法可能导致TMB数值有差异，因此，以WES作为黄金标准并校正panel区域是至关重要的。
癌种特异性: 各种癌症中TMB的阈值可能不同，需根据免疫检查点抑制剂（ICIs）的临床疗效数据来确定，以确保筛选出潜在的治疗受益者。
复杂性与影响因素: TMB的评估受生物学特性（如样本类型、肿瘤类型）、预处理条件、测序参数（如深度、平台）、生信分析（如突变类型过滤）以及阈值设定等多因素影响，需综合考量。
样本质量与肿瘤占比: TMB的准确评估依赖于高质量样本，尤其是肿瘤占比，过低的肿瘤成分可能导致TMB低估。
临床应用与考量
当临床医生面对一份包含TMB数值的NGS报告时，需要考虑检测方法的准确性（panel的选择）、突变谱的全面性（肿瘤占比和突变丰度）、绝对TMB值及其在同类样本中的位置，以此综合评估TMB的实用价值和可信度。TMB无疑为肿瘤免疫治疗的疗效预测提供了有力工具，但具体应用还需肿瘤科医师的专业指导。