法律分析：公司变更股东，本质上属于股权转让行为。依据《国家税务总局关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知》，自然人股权转让行为，转让方需要按“财产转让所得”计征个人所得税。因此，股权转让方应当将收益部分的20%缴纳个人所得税。即：以转让股权的收入额减除原值和合理费用后的余额，适用百分之二十的比例税率，计算缴纳个人所得税。但是，如果转让方以原价转让的，不交个人所得税。
法律依据：《企业所得税法》第二十三条 企业取得的下列所得已在境外缴纳的所得税税额，可以从其当期应纳税额中抵免，抵免限额为该项所得依照本法规定计算的应纳税额；超过抵免限额的部分，可以在以后五个年度内，用每年度抵免限额抵免当年应抵税额后的余额进行抵补： （一）居民企业来源于中国境外的应税所得； （二）非居民企业在中国境内设立机构、场所，取得发生在中国境外但与该机构、场所有实际联系的应税所得。