一、结构不同
1、全包围属内外结构，可以拆分为内、外两个部分。
2、独体字不能拆分。
二、包含范围不同
1、独体字
独体字包括全包围字，独体字指汉字的一个字只有一个单个的形体，不是由两个或两个以上的形体组成的。
2、全包围
由若干笔划交叉连接而形成的相对不变的结构称之为字根 由若干笔划交叉连接而形成的相对不变的结构称之为字根。
三、汉字示例不同
1、全包围
例如：围（囗＋韦）、国（囗＋玉）、“回”（口+口）、 “固”（口+古）、 “围”（口+韦），等等。
2、独体字
例如：古、中、首、手、而、乡，等等。
参考资料来源：百度百科-全包围结构
参考资料来源：百度百科-独体字