该园建于1982年，位于菏泽城东北济（南）兰（考）公路东侧，总面积1100多亩，由赵楼、李集、何楼、毛胡同4个自然村原有的几个牡丹园连接而成。牡丹品种600多个，是世界上品种最多、面积最大的牡丹园，是全国牡丹观赏旅游和生产、科研的中心。
曹州牡丹园建有南、北两座仿明代牌楼大门，在“凤凰戏牡丹”的彩色图案下，横置着原中国书法家协会主席舒同题写的“曹州牡丹园”五个镏金大字。
花园分3个观赏区，南大门以内为南观赏区。观花楼是该区主体建筑，登楼远望，千亩花海尽收眼底。楼上展室内有中国牡丹文化展，使游客在观赏千姿百态的牡丹之余，进一步了解中国牡丹灿烂的历史文化。观花楼前有“曹州牡丹甲天下”和“天下第一香”碑刻，分别由舒同和溥杰题写；还有汉白玉雕刻的牡丹仙子、葛巾玉版、天女散花等；松编鸟兽、人物、牌坊立于道旁，环境清幽。北大门以内为北观赏区。这里除大面积的牡丹及其它花木外，又有天香阁、西游记宫、花神殿、玉皇殿等景点和娱乐场所。区中心有一座座垂柳掩映的花亭，供人小憩，细细领略园内风光。亭东南，是东观赏区，以何楼、毛胡同两村的花园为基础扩建而成，这里除了各色名品牡丹外，还可以欣赏日本樱花。
每年牡丹盛开季节，中外游人慕名而来，络绎不绝，年游客量近200万人次。 位于花园路西，始建于明朝禧宗时。由当时官居工部尚书的曹州人何应瑞投资所建，人称何尚书花园。后为洪庙村郝家所买，故又名郝家花园。
建国初期，洪庙村花农在此种植牡丹、芍药，逐步连片成方。1958年在此基础上建成洪庙花园。1982年政府拨款重建，名为百花园。1990年，国家拨出大宗资金，由南京园林设计院规划，进行扩建。1993年第一期工程竣工，改名为曹州百花园。
该园占地100亩，植牡丹12万株，560多个品种；芍药6万株，270多个品种。园内花色齐全，分布合理，便于观赏。尤以培育珍贵品种而驰名。牡丹新品种赛雪塔、春红娇艳、银红球、百园粉等，都具有很高的观赏价值，曾获中国第一、二、三届花卉博览会新品种繁育奖。1989年，百花园与日本大阪改良园进行了牡丹、芍药品种交流，引进日本金玉、金阁、花王、太阳、日幕等26个优良牡丹品种和28个芍药品种。 位于曹州牡丹园西南侧，在菏泽城北5里王梨庄，是距城最近的花园。其前身是明代的“万花村花园”，主植牡丹、芍药。
民国初年，花园被曹州府的张培荣据为己有，改名军门花园。解放后，该园牡丹栽培面积逐年扩大，花色品种不断推陈出新。
