纯合子和杂合子的区别是纯合子是二倍体中
同源染色体上相同位点
等位基因相同的基因型个体，杂合子是指二倍体中同源染色体同一位点上的两个等位基因不相同的基因型个体。纯合子不会由于自交而分离出具有不同遗传因子的个体，因此，育种材料总是纯合的，保持其性状不变。杂合子自交可以得到纯合子。显性纯合子是指同源染色体上两个显性等位基因型完全相同的个体，全部用大写字母表示，如AA和AABB。隐形纯合子是指同源染色体上两个隐性等位基因型完全相同的个体，全部用小写字母表示，如aa和aabb。
区分某生物是杂合子还是显性纯合子，可通过自交、测交、花药离体培养或花粉鉴定等方法。
1. 自交的方式：让某显性性状的个体进行自交，若后代能发生性状分离则亲本一定为杂合子；若后代无性状分离，则可能为纯合子。此时是最简便的方法，适合于植物，不适合于动物。
2. 测交的方式：让待测个体与隐性类型测交，若后代出现隐性类型，则一定为杂合子；若后代只有显性性状个体，则可能为纯合子。待测对象若为雄性动物，注意与多个隐性雌性个体交配，以使后代产生更多的个体，使结果更有说服力。
3. 花药离体培养法：用花药离体培养形成
单倍体植株并用秋水仙素处理，加倍后的植株为纯合子，根据植株性状进行确定