2007年，辅仁药业集团收获多项荣誉，被评为“2006年度中国制药工业百强”，并顺利启动了辅仁工业园区三期工程。同年，上海辅仁实业(集团)股份有限公司的股票简称更改为更具识别度的“上海辅仁”。
2006年5月，辅仁药业集团再次荣膺“2005中国制药工业百强”称号，同时，集团更换了新的商标标志，确立了新的发展方向，展现了其强劲的发展势头。
2005年，辅仁药业集团通过一系列重大举措，如成功入主上海ST民丰和河南辅仁堂制药有限公司的上市，以及对生产基地的全面改造并通过GMP认证，显示了其在行业中的领先地位和实力。
2004年，集团对开封豫港制药生产基地进行了大规模的资金投入，进一步提升了生产能力。2003年，辅仁药业集团投资5亿元，建设了亚洲最大的产能车间，彰显了其规模和前瞻性。
2002年，辅仁药业集团并购宋河酒业股份有限公司，进一步拓宽了业务领域，同时河南辅仁医药科技开发有限公司的成立，标志着集团科技研发能力的提升。这一年，集团并购河南辅仁怀庆堂制药有限公司，巩固了其在制药行业的地位。
早在2001年，辅仁药业集团便成功并购了河南辅仁怀庆堂制药有限公司，并使其全面通过GMP认证。开封豫港制药有限公司也在同年通过了GMP认证，展现了集团对质量控制的严格把控。
1999年，辅仁的产品开始投放市场，标志着集团业务的正式起步。1998年，集团获得了药品生产许可证，为后续的稳健发展奠定了坚实的基础。
辅仁药业集团有限公司是一家以药业、酒业为主导产业，集研发、生产、经营、投资、管理于一体的综合性集团公司。