1.1 抑菌作用
有机酸可通过解离出的酸根离子或者氢离子进入细菌细胞膜内使胞内渗透压增加，内环境的酸值降低,导致细菌正常代谢紊乱，甚至裂解死亡，间接降低有害细菌的数量。例如柠檬酸、苹果酸、乳酸等，此类有机酸饲料添加剂可在水产动物的肠胃中起作用。其中，柠檬酸 （C6H8O7H2O）是一种酸性较强的有机酸，可以解离出3个H+，抑菌效果较好，能够作为饲料酸化剂。
有机酸不仅可以降低环境中的 pH 值，还可以通过破坏细菌细胞膜、干扰细菌酶的合成、影响细菌 DNA 的复制等达到抑菌的目的。如甲酸和山梨酸。山梨酸对鱼虾肠胃内的细菌具有较强的抑菌活性，它可以通过自身生命活动产生山梨酰基过氧化物来抑制天冬氨酸酶的活性，进而破坏细胞膜的通透性、阻碍细胞的分解和合成等，使细菌处于休眠状态甚至死亡。
有机酸可以在胃内促进有益微生物如乳酸菌类的生长，使其在适宜的条件下充分繁殖。乳酸菌数量增多后会夺取大量的养分和空间，破坏大肠杆菌等必要生存条件而致其死亡。有机酸还可有效抑制水产动物体内病原微生物大肠杆菌、沙门氏菌等有害菌的增殖，从而达到防止水产动物疾病和促进生长的目的。
1.2 缓解重金属 Pb 、 Cd 等毒性，降低养殖环境的污染
有机酸以水体泼洒的方式进入养殖环境中，通过吸附、氧化或者络合Pb 、Cd 、Cu 、Zn等重金属，缓解重金属的毒性。不同有机酸作用于重金属镉的试验结果表明，酒石酸、草酸、苹果酸、柠檬酸、乙酸都有利于重金属 Cd2+ 向交换态转变，在一定范围内质量摩尔浓度增加，解毒效果越好，其中柠檬酸和乙酸的效果最好，仅次于络合剂EDTA，苹果酸的效果最差，但仅较络合剂 EDTA解毒效果略差一些。有机酸除了能一定程度地降解重金属外，还可增加水中的氧气,改善黄颡鱼的厌食症状。
此外，有机酸还可使养殖废水中的分子氨转化为 NH4+，然后结合氨离子生成稳定的铵盐，降低水中有毒氨的毒性。草酸和柠檬酸等还可加速污染水质中磷的转化。
1.3 促进消化、增强抵抗力和抗应激作用
有机酸通过影响代谢活动,提高酶活性来促进水产动物的消化。某些有机酸如柠檬酸可参与三羧酸循环和 ATP 的生成与转化,加快水产动物的代谢。延胡索酸能提高线粒体腺苷酸环化酶、胃内酶等的活性,利于产生能量和分解脂肪、蛋白质等大分子物质,促进吸收和利用；还参与氨基酸转换,在应激原的刺激下,机体可合成 ATP,产生抗应激作用 。
有机酸能够减少氨的合成和抑制生成有害的代谢产物，还能阻碍免疫介导因子的合成和分泌，提升机体抵抗力。
有机酸能够促进水产动物生长和繁殖,还能减少水产动物因细菌感染产生的疾病。试验表明,饲料中添加有机酸盐或其复配物可提高虾的免疫指标抗病能力,提高动物的营养价值。有机酸通过促进水产动物肠道内有益菌 (如双歧杆菌、乳酸菌等)的繁殖,抑制有害菌繁殖,使肠道菌群结构向好的方面改变,促进维生素钙等的吸收,提高水产动物的抗病能力和抵抗力。
1.4促进摄食、提高消化率和增重率
有机酸可促进水产动物对食物的吸收、提升蛋白质的利用率，进而提高水产品的产值与品质，在鱼类虾类河璧等中大量使用。有机酸作为酸化剂通过提高饲料的酸度，使胃蛋白酶、胰蛋白酶等的活性增强，代谢活动变强,增加水产动物对饲料的消化效率促进生长，且不同类型有机酸酸化剂对鱼类的生长效果有所差异。草鱼肠道内和肝胰脏内的淀粉酶、脂肪酶蛋白酶的活性加强。L-苹果酸可使罗非鱼胃肠内的淀粉酶和脂肪酶活性高于对照组，且酶活性会随着L-苹果酸含量的增加而升高。例如在鱼司料中添加果酸和柠檬酸可促进鱼类胃肠道对营养物质(糖类维生素蛋白质等)的吸收、转化和利用，掩盖饲料的不良气味，提高适口性。而添加甲酸、丙酸可抑制有害菌的生命活动，提高饲料的利用率，加速鱼的生长与繁殖。
1.5有助于培藻，增强池塘自净能力，提高生产力
在高pH塘口使用有机酸除了降低pH以外，同时可以为藻类提供碳源，使有益藻类更容易生长，抑制有害藻类。
1.6降低水体pH和稳定水质
在放苗前及养殖过程中使用，能迅速降低高的pH值，并稳定池水的pH值，稳定水质。
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