一、开始降解的端向不同
3‘5’核酸外切酶从3‘端开始降解DNA，而5’3‘核酸外切酶从5’端降解DNA。
二、水解磷酸二酯键生成的酶种类不同
水解磷酸二酯键的3′端生成5′-单核苷酸的酶，有蛇毒磷酸二酯酶及大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ等； 水解5′端生成3′-单核苷酸的酶有脾脏磷酸二酯酶、嗜酸乳杆菌（Lac-tobacillus acidophilus）核酸酶。
三、反应的方向不同
一般的是水解出3'游离羟基和5'游离磷酸基团，水作为亲核试剂对5'侧的磷原子进行亲和加成，形成不稳定中间体后 3'侧的羟基发生消除反应和一般的酯类水解类似，不过是在酶的催化作用下完成的一般的水解酶中有Ser或者Tyr等含有羟基的活性位点，可以在代替水进行亲和进攻 。
扩展资料
单链：单链的核酸外切酶包括大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ（exoⅠ）和核酸外切酶Ⅶ（exoⅦ）。核酸外切酶Ⅶ（exoⅦ）能够从5′-末端或3′-末端呈单链状态的DNA分子上降解DNA，产生出寡核苷酸短片段，而且是唯一不需要Mg2+离子的活性酶，是一种耐受性很强的核酸酶。
双链：双链的核酸外切酶包括大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ（exoⅢ）、λ噬菌体核酸外切酶（λexo）以及T7噬菌体基因6核酸外切酶等。大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ（exo Ⅲ）具有多种催化功能，可以降解双链DNA分子中的许多类型的磷酸二酯键。
参考资料
35核酸外切酶和53核酸外切酶有以下三个区别：
1、一条DNA有2端，就像一条绳子有两头一样，3‘5’核酸外切酶可以从3‘端开始降解DNA，而5’3‘核酸外切酶可以从5’端降解DNA；
2、水解磷酸二酯键的3′端生成5′-单核苷酸的酶，有蛇毒磷酸二酯酶及大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ等； 水解5′端生成3′-单核苷酸的酶有脾脏磷酸二酯酶、嗜酸乳杆菌（Lac-tobacillus acidophilus）核酸酶。
3、从反应的角度看 区别只有反应的方向不一样，作用方式就是磷酸二酯键的水解作用，一般的是水解出3'游离羟基和5'游离磷酸基团，水作为亲核试剂对5'侧的磷原子进行亲和加成 形成不稳定中间体后 3'侧的羟基发生消除反应和一般的酯类水解类似。
扩展资料：
核酸内切酶与外切酶区别
1、水解位置不同
核酸内切酶是一类能从DNA分子中间水解磷酸二酯键,从而切断双链DNA的核酸水解酶。核酸外切酶是一类能从多核苷酸链的一端开始按序催化水解3、5-磷酸二酯键，降解核苷酸的酶。
2、切点要求不同
核酸内切酶的切点大多很严格，要求专一的核苷酸顺序，即识别顺序。而核酸外切酶的切点要求比较低。
3、分类不同
核酸内切酶可分为DNaseⅠ、DNaseⅡ等分解DNA的酶，以及RNase、RNaseT1等分解RNA的酶。一般来说，大都不具碱基特异性，但也有诸如脾脏RNase、RNaseT1等或限制性内切酶那种能够识别并切断特定的碱基或碱基序列的酶。
可大致分为水解磷酸二酯键的3′端生成5′-单核苷酸的酶，及水解5′端生成3′-单核苷酸的酶。前者有蛇毒磷酸二酯酶及大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ等；后者有脾脏磷酸二酯酶、嗜酸乳杆菌核酸酶。
参考资料：百度百科—外切酶
本回答被网友采纳1、一条DNA有2端，就像一条绳子有两头一样，3‘5’核酸外切酶可以从3‘端开始降解DNA，而5’3‘核酸外切酶可以从5’端降解DNA；
2、水解磷酸二酯键的3′端生成5′-单核苷酸的酶，有蛇毒磷酸二酯酶及大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ等； 水解5′端生成3′-单核苷酸的酶有脾脏磷酸二酯酶、嗜酸乳杆菌（Lac-tobacillus acidophilus）核酸酶。
3、从反应的角度看 区别只有反应的方向不一样，作用方式就是磷酸二酯键的水解作用，一般的是水解出3'游离羟基和5'游离磷酸基团，水作为亲核试剂对5'侧的磷原子进行亲和加成 形成不稳定中间体后 3'侧的羟基发生消除反应和一般的酯类水解类似，不过是在酶的催化作用下完成的一般的水解酶中有Ser或者Tyr等含有羟基的活性位点，可以在代替水进行亲和进攻 。
扩展资料：
核酸外切酶分类：
1、单链：
单链的核酸外切酶包括大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ（exoⅠ）和核酸外切酶Ⅶ（exoⅦ）。核酸外切酶Ⅶ（exoⅦ）能够从5′-末端或3′-末端呈单链状态的DNA分子上降解DNA，产生出寡核苷酸短片段，而且是唯一不需要Mg2+离子的活性酶，是一种耐受性很强的核酸酶。
核酸外切酶Ⅶ（exoⅦ）可以用来测定基因组DNA中一些特殊的间隔序列和编码序列的位置。它只切割末端有单链突出的DNA分子， 实际操作时需要配合解旋酶操作。
2、双链：
双链的核酸外切酶包括大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ（exoⅢ）、λ噬菌体核酸外切酶（λexo）以及T7噬菌体基因6核酸外切酶等。大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ（exo Ⅲ）具有多种催化功能，可以降解双链DNA分子中的许多类型的磷酸二酯键。
其中主要的催化活性是催化双链DNA按3′→5′的方向从3′-OH末端释放5′-单核苷酸。大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ（exoⅢ）通过其3′→5′外切酶活性使双链DNA分子产生出单链区，经过这种修饰的DNA再配合使用Klenow酶，同时加进带放射性同位素的核苷酸，便可以制备特异性的放射性探针。
参考资料来源：百度百科-外切酶
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