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明治维新一开始的时候，日本的议会、宪法还未成形，国家形式仍是藩阀政治（和今日菲律宾差不多）。那么作为明治倒幕主力军的萨摩和长州对政府自然有着重大影响。
其中萨摩势力（海军），就如清朝一样，向英国看齐；而长洲势力（陆军）的学习对象则是大陆国家法国，在普法战争后又转向胜利的德国。
20世纪30年代陆军内部分裂为皇道派和统治派，226兵变后皇道派被打压，以东条英机为首的统治派上台。陆军亲德国意大利，海军亲英美。陆军要加入轴心国，海军反对轴心国，要与英美妥协。最后陆军占上峰，打压海军。海军出身的首相米内光政下台。陆军东条英机出任首相，二战全面爆发 ,日本陆军基本负责中国和南洋战线，海军负责太平洋及其岛屿战线。二战日本海军损失最大，全军覆灭，海军指责陆军偷懒，陆军指责海军不打胜仗浪费资源。东条英机后来兼任陆军大臣，首相，参谋总长等要职，偏向陆军。海军作战部长成了东条的傀儡。
旧日本军队和现今东亚的许多政治团体一样，有着鲜明的「派阀（はばつ）」对立。军队中的派系往往称为“军阀”（military clique），影响军阀结成的因素通常有：
1.政见与战略
依照政见划分的陆军主要派系有：
最为著名的萨长藩之争
主张将藩阀清除出军部的巴登巴登密约派（冈村宁次、小畑敏四郎、永田铁山）
支持天皇亲政的皇道派/国体原理派（荒木贞夫、真崎甚三郎）
支持扩军主义的统制派（永田铁山、东条英机）
支持翼赞议会（即国家控制立法机构）的樱会（牟田口廉也、武藤章、辻政信、长勇）
依照政见划分的海军主要派系有：
依然是萨长藩的对立
以军令部为代表，反对华盛顿条约的舰队派（伏见宫博恭王、加藤宽治、大角岑生）
以海军省为代表，支持裁军主义的条约派（财部彪、堀悌吉、米内光政、山梨胜之进、井上成美）
支持民选，亲近英美的海军左派/稳健派（山本五十六、米内光政、井上成美、长谷川清、高木惣吉）
依照战略划分的主要派系有：
主张夺取满蒙作为攻击苏联跳板的北进/满洲派（关东军）
主张夺取南洋掠夺资源的南进派（武藤章、铃木贞一）
主张以航空兵作为海军未来发展方向的航空派/战舰废止派（大西泷治郎、源田实）
2.血缘与地缘
海军的东北出身：山本五十六（新潟长冈）、南云忠一（山形米泽）、山梨胜之进（宫城仙台）、井上成美（宫城仙台）
兄弟从军：百武三郎（海军大将）、百武源吾（海军大将）、百武晴吉（陆军中将）
姻亲与过继：写《机动舰队》的奥宫正武同学（海军中佐），他的义兄是山口多闻（海军中将）。他弟弟奥宫正澄的义父是栗田健男（海军中将）。他本人的妻子是由山本五十六夫妇介绍而来的。
3.人脉与学阀（陆士/陆大、海兵/海大、其他专业学校）
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