1、容易滋生霉菌。酿酒的葡萄需要成熟度高、无破损、无发霉等现象。葡萄在常温下不易保存，很容易发生霉变，如果新鲜度不高，会使酒中更容易滋生霉菌。所以，一定要选择新鲜的葡萄，切不可把葡萄买回家存放几天后才开始酿酒。
2、糖分过多危害健康。其实大部分葡萄酒酿造都尽量避免含糖。在葡萄酒发达的国家，人们为了让葡萄酒中少含糖甚至不含糖，进行了一轮又一轮的艰苦探索。而家酿过程中却选择多加糖帮助发酵，葡萄酒本身对人体有益，即使糖尿病人也可以喝，但如果其中加过多的糖，对人体就会有一定的危害。
3、容器易发生化学反应。平时酿葡萄酒，家里的瓶瓶罐罐、水桶、大缸几乎都在使用，玻璃瓶、可乐瓶、矿泉水瓶等也时常“上阵”。其实酿葡萄酒时最好不要用塑料、不锈钢、铝器皿等来盛装，以免发生化学反应，产生对身体有害的物质。酿酒最好选用玻璃器皿。
4、发酵时间、温度无法控制。一般家庭自酿葡萄酒一个月时间就开始饮用，但是，正常情况下的葡萄酒酿造，白葡萄酒需要3-4个月的发酵时间，红葡萄酒则需要1-2年的发酵时间，发酵温度一般情况下不超过20度。而家庭自酿却无法保证时间和温度。
5、酚含量较少。至于说到营养成分，据品酒师鉴定，自酿酒含酚类的物质比较少，和真正的干红葡萄酒还是有很大差距的，自酿葡萄酒偶尔喝些还是可以的，但是不适合经常饮用。
6、隐藏有害物质。自己酿制的葡萄酒中可能隐藏着甲醇和杂醇油，对身体有一定毒副作用，目前家庭酿制葡萄酒还没有除去甲醇和杂醇油的工艺，所以有人喝完自家的葡萄酒后，会出现头痛肚闷的症状。
贮藏方式：
若想将葡萄酒（木塞瓶装）长期储存，最好能做到平放、恒温、恒湿、通风、避光、避震。而橡胶塞、螺旋盖的葡萄酒却有小小的区别。
1、平放
葡萄酒以平放摆置较理想，这样才能让软木塞和葡萄酒接触到，以保持它的湿润度，否则若将酒直放，时间太久，会使软木塞变得干燥易碎，而无法完全紧闭瓶口，造成葡萄酒的氧化。
2、恒温
葡萄酒贮藏环境的温度，最好维持在12－15℃，否则温度变化太大，不仅破坏葡萄酒的酒体，在热胀冷缩的作用下，还会影响到软木塞而造成渗酒的现象。所以，若贮酒环境能够维持在5-20度的某一温度下，保持±2度的变化内，也都是比较理想的。
然而在夏天高温的时候，没有任何辅助条件（恒温柜、地窖等）的情况下，应让葡萄酒的储存恒定在一个温度上，如26度，保持±2度的变化内，这样也能保证几个月内葡萄酒的品质没有太大的影响。家里有葡萄酒存放时，对空调的使用确是应该注意。
3、恒湿
若贮酒环境太湿，容易造成软木塞及酒标的腐烂，太干则容易使软木塞失去弹性，无法紧封瓶口，所以70左右的湿度，是最佳的贮酒环境。
4、通风
葡萄酒像海绵一样，会将周围的味道吸到瓶里去，所以，在贮酒环境中，最好能保持通风状态。而且不要在同一个环境中摆放味道太重的东西，以免破坏酒的味道。