在未来世界中，一群以希特为首的人因无视环保，过度依赖科技和自然资源，导致环境恶化，动物濒危，人类生存受到威胁。在这个危急时刻，机智勇敢的延羽在父亲的引导下，与伙伴林嘉静以及凌义、基洛等环保志士一同行动。他们从金波城出发，旅行世界各地，试图改变人们的思想，例如在绿荫市恢复了生机，水之都的海水重获清澈，甚至平息了炎部落的山火。
在他们的努力下，延羽与伙伴们阻止了希特的破坏行为。然而，战斗并未结束。在沙砾市，他们遭遇了邪灵组织的入侵，假冒机甲五勇士的五人企图夺取灵土矿石。在沙漠中，延羽与小骆驼薯太郞结下友谊，并在危急关头成为守护灵土矿石的灵驼。在生命之源，他们与邪灵展开激战，最终借助无双龙神的力量击败敌人，封印了生命之源。
面对邪灵组织的威胁，凌义陷入兄弟对战的困境，而延羽等人则发现邪灵的目标是金波城的黄金圣杯。他们兵分两路，延羽等人寻找圣杯，而嘉静等人则发现邪灵企图利用灵狮化石制造更强机甲。在一系列战斗中，他们揭露了邪灵的阴谋，最终救出被囚禁的博士，并得知向荣的真实身份。
尽管面临巨大挑战，延羽和伙伴们坚持不懈，最终在凌义的牺牲和合体机甲的帮助下，击败了罗煞。然而，他们发现只有借助机甲召唤器的陨石能量才能阻止世界的机械化。经过痛苦的选择，他们舍弃了机甲，世界恢复了和平。机甲兽神的使命，是守护这个世界的平衡，而他们的牺牲与决心，成为了这个和平时代的守护者。
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