摩托车合格证不能二维码扫描，不能上牌。证书需要更换。
新的摩托车许可流程:
在办理牌照前，你要先携带新购买摩托车的发票、合格证、身份证到国税局办理车辆购置税附加税，并到保险公司为你的摩托车办理机动车第三者责任强制保险。完成上述业务后，到公安局交警大队车管所办证大厅办理牌照。如果手续齐全，可以一次性完成。
机动车所有人申请登记时，应当填写申请表，交验机动车，并提交下列证件和凭证:
机动车所有人身份证明、购车发票等机动车来历证明、机动车整车出厂证明或者进口机动车进口证明、车辆购置税完税证明或者免税证明、机动车交通事故责任强制保险证明、车船税完税或者免税证明。