城乡居民医疗保险的起付线，比新农合高，在大医院的报销比例也比新农合高；而新农合在乡镇卫生院的报销费用就比较高。城乡居民医疗报销的缴费是每个月都要交，最高可以报销70%，新农合是一年交一次，最高报销30%。
报销比例：
1、一级医院：起付线300元，报销比例为60%；二级医院：如果是在县二级医院就医，医疗费用在6000元以下的报销比例为60%，高于6000元的报销比例为80%，起付线是四百元。如果是在市二级医院，报销比例还是一样的，区别是起付线为600元。
2、三级医院：如果你是在县级三级医院就医，医疗费用在6000元以下报销比例为65%，高于6000元报销比例为80%，起付线600元。如果你是在市级三级医院看病就医，医疗费用在一万二以下报销比例为55%，高于一万二的报销比例为75%，起付线为800元。
3、市外医院：医疗费用杂两万元以下的报销比例为45%，高于两万元的报销比例为70%，报销的起付线是1500元。
医保和新农合的区别:
1、 所覆盖的对象不同
职工医疗保险是城镇所有用人单位，包括企业（国有企业、集体企业、外商投资企业、私营企业等）、机关、事业单位、社会团体、民办非企业单位及其职工，都要参加。
乡镇企业及其职工、城镇个体经济组织业主及其从业人员是否参加基本医疗保险，由各省、自治区、直辖市人民政府决定。新农合必须是有农村户口才可以办理。
2、 缴费主体不同
职工医疗保险是指国家通过立法强制规定，用人单位和社会成员个人共同缴纳医疗保险费，建立医疗保险基金。
新型农村合作医疗制度是由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。
3、 缴费方式不同
医疗保险具有强制性，是单位和职工共同缴纳的，并需要缴纳时间达到一定的年限。
新型农村合作医疗是农民自愿参加，而且必须以家庭为单位整户参加，且需要每年办理参保缴费手续。
4、 缴费标准不同
职工基本医疗保险缴费和个人工资有关，按照相关规定的比例标准缴纳，分为几档可以选择，一般单位承担8%，个人承担2%。职工医保的缴费标准远高于新农合。
新型农村合作医疗的缴费标准有每年100元、200元、300元、400元、500元，各个地方根据自身的情况来设置缴费的档次，不同的省市，因为经济水平的不同，缴费标准有所不同，具体金额可拨打当地社保局电话12333进行免费咨询。小保这里新农合今年缴费是150元。
5、 报销比例不同
职工基本医疗保险参保人拥有个人账户，定期会有费用划入，报销比例较高，有起付标准，限额较高，医疗费不封顶。职工基本医疗保险参保人员完成缴费年限后可以终身享受。
新型农村合作医疗没有个人帐户，报销比例也比职工基本医保要低，限额较低，并且是一年一参合，参合本年度享受的报销。
6、报销范围不同新农合在农村乡镇医院的报销比例较高，到市级以上医院报销比例相对社保较少，但两者都是随着医院的级别升高而降低。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》第二十三条
职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。
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