《水文地质环境地质调查信息系统》提供了较强的数据处理及初步评价功能，具备了前述基础资料，可进行数据统计，自动生成统计图表，建立地下水资源开采潜力评价、地下水资源功能评价、地下水水质综合评价等模型，为综合研究提供了便利。使用时应注意以下几个问题：
（1）《水文地质环境地质调查信息系统》运行环境
硬件运行环境推荐为Intel奔腾100 MHz主频，128 MB内存，1024×786×256色，500 MB可用硬盘空间上的PC兼容机。
软件环境为中文Windows2000以上的操作系统（中文Windows2000/NT/XP）。由于其主体是在Map GIS 6.5基础上开发的，在Map GIS 6.7环境下无法运行。
（2）属性数据库所录入的水质分析综合成果中，“＜”不能录入，所以凡出现0.0005和0.0002的数据，可能是＜0.0005或＜0.0002，因此对水质数据的使用应注意。
（3）在录入系统中查看某个点的数据时，不要习惯于在统一编号下拉菜单中选择，这样的操作会更改统一编号的数据，应在工具栏中选择相应的图标进行查看。
（4）如果数据在本系统中汇总失败，可以在SQL Server中进行数据还原。