九阴真经全真七子与黄药师对战是在第6集中。
第6集主要内容：黄药师与全真七子纠缠之时，曲三带着冯蘅逃跑，却不慎被铁掌帮所擒。 欧阳峰救出冯蘅， 告诉黄药师，只要与他比武，就把冯蘅交给黄药师。 无奈之下，黄药师只好与欧阳峰比武。二人两败俱伤之时，裘千仞乘虚而入，却被两人所伤。二人因受外人骚扰受了严重内伤，比武暂停，胜负未分，欧阳峰将冯蘅交给黄药师，回白驼山养伤。 全真七子又与铁掌帮围攻黄药师，被曲三放了烟雾弹所救。黄药师运功疗伤，告诉冯蘅半柱香之内不能被骚扰。陈玄生找到了他们，冯蘅拼死保护黄药师。一句“你要杀就杀我”惊醒了黄药师。 黄药师打倒了陈玄生之后又放了他。 陈玄生突然觉得也许黄药师并不是大奸大恶之徒。梅若华上山采集奇毒，遇到了陈玄生。两人交手之际，梅若华将蛇毒洒向陈玄生的眼睛。眼看着快跌下山崖，陈玄生拉上了梅若华一起。山崖之下，陈玄生双目失明，梅若华摔断双腿无法行走尽管如此，两人还是不停的争吵。怎么上也上不去。累了，只好休息。陈玄生突然被蛇咬伤，晕了过去。 梅若华帮他吸出毒液。两个人都是如此的嘴硬心软…… 终于找到了出口，陈玄生背着梅若华爬了上去，自此之后，两人是友非敌。是情是敌，只在一线间…… 梅若华偷偷来到铁掌帮，治好了陈玄生的眼睛。水声伴着笛声，在天边响起。蘅和黄药师正坐在船上。 我本来说过要一生一世保护你的，想不到这次反而让你照顾我。」 「你说让我一生一世都跟着你，你要出了事，那我跟谁啊？」 黄药师默契的一笑。 「药师，我想再看看那幅画。不知道为什么，我每次看到它，就想起金国。我真不明白，为什么那么多人抢它。」 正当此时，金国的士兵突然上了船。黄药师与士兵交手，一盏灯却引起了整条船的爆炸。醒来时，黄药师躺在一座孤岛上，身旁剩下的，只有那幅画，还有一片桃花。黄药师碰到一个陌生人，被他打伤，还无意帮他破了妻子为他设下的棋局。黄药师体力不支晕倒了。「你醒了，喝杯茶吧。」 「这位姑娘，是你救了我？」「我看见你晕了又受了伤，所以就把你扶回来了。」谢谢。」「这里是哪啊？」「这里是桃花岛，是我从小长大的地方，我叫杨紫烟。」「紫烟姑娘，在下黄药师，和朋友失散了，想找她。」 我带你去找。」「好。」杨紫烟把黄药师带到海边。黄药师找了一根树枝，将它做成笛子。在海边吹着《碧海潮升曲》。他希望冯蘅听得到，希望她听到，就能来到他身边……
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