用分子和原子的观点来解释化学反应的实质如下：旧化学键断裂和新化学键形成的过程。
分子和原子的区别：
分子是保持化学性质的最小微粒，由原子构成，在化学反应中可以再分割，提出时间晚于原子；而原子是化学变化中的最小微粒，由质子和中子组成，在化学反应中不可分割，提出时间要早于分子。
1、本质区别
在化学变化中，分子可分，原子不可分。分子是保持化学性质的最小微粒，在化学变化中，分子变为原子，原子再重新结合，原子是化学变化中最小微粒。
2、组成结构不同
原子由质子和中子组成，正原子的原子核由带正电的质子和电中性的中子组成，负原子原子核中的反质子带负电，从而使负原子的原子核带负电。而分子是由原子构成的，原子通过一定的作用力，以一定的次序和排列方式结合成分子。
3、参与化学反应性质不同
原子是化学反应不可再分的基本微粒，原子在化学反应中不可分割。而分子在化学反应中可以再分割，不同物质的分子中各种原子进行重新结合。
4、历史发展不同
原子的提出早于分子。1789年，法国科学家拉瓦锡定义了原子一词，从此，原子就用来表示化学变化中的最小的单位。
而最早提出确切的分子概念的是阿伏伽德罗，他于1811年发表了分子学说，认为：“原子是参加化学反应的最小质点，而分子则是在游离状态下单质或化合物能够独立存在的最小质点。”
化学键的基本介绍：
原子的化学物质。键由两相反电荷间的电磁力引起，电荷可能来自电子和原子核，或由偶极子造成。化学键种类繁多，其能量大小、键长亦有所不同。
在原子中，带负电、绕原子核运行的电子与核内带正电的质子互相吸引，而位于两原子核之间的电子则皆受两方吸引。因此，原子核和电子间最稳定的组态，是当电子位处两原子核间之时。
这些电子使原子核能够彼此相吸，形成所谓的化学键。然而，化学键并不能减少个别粒子所构成的体积。由于电子的质量较小且具有物质波性质，它们相较于原子核而言占据了极大部分的体积，使原子核之间距离较远。