中国热带农业科学院热带生物技术研究所拥有先进的科研平台，其中包括转基因检测中心。该中心在2008年4月通过了国家认证认可监督管理委员会和农业部的实验室资质认定与农产品质量监督检验测试机构审查，具备了严谨的实验环境。中心占地面积800平方米，设有办公室和两个检测室，分别为转基因植物及其产品成分检测和环境安全检测，配备了13名专业人员，其中高级职称9人，中级职称3人，人员结构合理。
中心装备了各类高端仪器，如全自动数码凝胶图象分析系统、常规PCR、酶联免疫仪等，仪器设备配备率超过100%，实验室设施完善。此外，试验基地面积超过100亩，包括温室、网室、焚烧炉等设施，为科研工作提供了优良的工作条件。至2011年，中心已承担多项转基因作物检测任务，如南繁基地的转基因作物管理、植物新品种保藏样品检测等，对转基因生物技术的发展起到了关键作用。
实验基地主要职责包括科技成果孵化、转化，产品生产和销售，以及提供农业科技服务和示范推广。研究所正在进行多项项目开发，如橡胶幼态无性系种苗、脱毒甘蔗苗、石斛兰花组培苗等，以及天然药物的开发利用和转基因作物食品安全鉴定。此外，还有能源作物品种培育、新型花卉种苗工业化生产、土壤分析测试等潜力项目，以及香蕉枯萎病抑制剂菌种培育和水产养殖病害防治试剂的研究。
中国热带农业科学院热带生物技术研究所是根据“国科发政字2002356号”文件批复，在中国热带农业科学院组建的非营利性研究所，是热科院5个非营利性研究所之一。该所2002年10月登记注册，2003年6月正式挂牌。热带生物技术研究所设立在海口院校区，以热带作物生物技术国家重点实验室为基础组建，同时整合原橡胶栽培研究所、热带农牧研究所、植物保护研究所的部分科研骨干力量，分流部分基地试验人员，引进新增设学科的部分国内外优秀人才。