促醒者分集剧情如下：
第1集
广阔无垠，茫茫千里的内蒙古戈壁，飞沙扬砾中韩西林用精湛的中医针法救治着当地牧民。另一边，丁学坤的儿子丁远志，已经是瑞典当地颇有名气的青年医生，在完成一台手术后，接到了来自燕京第九医院的电话。
第2集
深夜的病房里，谭母在给谭淼淼用中药擦拭身体，看着躺在病床上的女儿，谭母想到了自己一直对谭淼淼的过度控制，导致母女二人的关系破裂。次日，谭母决定终止促醒，提前手术。
第3集
司徒院长按照之前的承诺，将丁学坤生前的抑郁症治疗记录交给了韩西林。走廊内，韩西林与丁远志偶遇，二人各怀心事。夜晚，韩西林翻看着丁学坤生前的抑郁症治疗记录，但并未从中发现任何可疑之处。
第4集
陆之舟为了满足儿子的愿望，找潘小艾帮忙，潘小艾想到了韩西林。韩西林偷偷给高远山做眼内针，暂时恢复高远山一半的视力。但这场违规的私下治疗还是被丁远志发现。
第5集
韩西林组织大家回想张嘉明失踪之前的线索。通过一番整理，发现了诸多疑点。韩西林得知，张嘉明是潘小艾第一个也是最重视的一名患者，甚至为了鼓励张嘉明，还拉着苗豆豆一起做了为关爱渐冻症的冰桶挑战，潘小艾在业余时间都会寻找有关渐冻症患者的最新治疗信息并发给吴亚楠。
第6集
王恒之极力安抚张父，情绪激动的张母犯了哮喘。没带药的张母，在韩西林的一番针灸治疗下，渐渐恢复了平静。韩西林询问潘小艾，张嘉明到底在哪里，并向潘小艾说明了患者在外的危险性。
第7集
深夜，丁远志拿着快递单气势汹汹地找韩西林对峙，不远处，“黑影人”躲在角落里偷听着，韩西林谎称丁学坤给自己快递的不是医疗日记，而是一些病人的病历。次日，急诊来了一个非常奇怪的病人，名叫张蔷薇。
第8集
回到办公室，韩西林在实验室门上加了一道锁，后将门缓缓藏在移动书架中。此时，又有人来敲门，林雅婕一脸严肃的出现在门口。林雅婕希望韩西林离开九院，并劝韩西林放弃追查丁学坤的事情。
第9集
韩西林与林雅婕来到了东郊医院，认识了其师父丁学坤生前的同事，东郊医院的秦主任。韩西林本想询问秦主任有关师父丁学坤的事情，却被林雅婕打断。
第10集
丁远志、林雅婕、戴繁荣三人碰到了李翘，林雅婕问起了胡三的情况，李翘只好交代胡三失踪的事情，戴繁荣趁机开始嘲笑神经内科最近总是丢病人。林雅婕严肃地告诉丁远志，必须在当日一点之前找到胡三。
第11集
神经内科会议上，司徒院长夸奖丁远志的路径非常成功，丁远志表示是韩西林为路径做出了更加良好的改革方案。林雅婕来病房看望马上就要出院的胡三，胡三告知林雅婕，韩西林曾找过自己询问丁学坤生前的事情。
第12集
丁远志和大家对小暖的治疗方案进行讨论，希望其尽快实施血管移植手术，韩西林忽然出现表示反对。韩西林认为患儿年纪太小，血管还没有完全发育，不能冒然做这种存在巨大风险的手术，应先用中药活血化瘀后再做打算。
第13集
九院众人聚餐欢迎韩阔海，韩阔海应付完众人，走到了韩西林身边。本就不和的父子二人见面很是尴尬。韩阔海先发制人，责问韩西林为什么要继续调查丁学坤的死因，韩西林各种讽刺韩阔海，两人不欢而散。
第14集
回到医院的林雅婕与司徒院长交谈，林雅婕表示已经将文件交给了韩阔海，并询问司徒院长真的要重新启动这个项目吗？司徒只是要她全力配合韩阔海就可以了。
第15集
司徒院长找到丁远志告知，韩西林手里的项目是其父亲丁学坤生前的最后一个方案，而且是自己给他的，司徒表示瑞典方面非常看好韩西林手中的项目，请求丁远志卖给自己一个人情。
第16集
次日项目大会上，韩西林意外宣布自己放弃项目研究，一直希望自己儿子韩西林能够有所作为的韩阔海大为震怒，众人对于韩西林放弃方案的事情议论纷纷。
第17集
洪生在急诊室突然犯起癫痫，韩西林与丁远志及时赶到为其治疗。洪生病情得到稳定，韩西林借机从洪生父亲口中得知丁学坤与其的往事，并提及仓门基金在两个月前曾出现过一次断药的情况。
第18集
李翘告知韩西林，洪生决定不做手术，韩西林思索后，询问此决定出自患者本人还是其家属，此时苗豆豆慌张赶来，告诉二人，洪生绝食了！韩西林支开众人，当面戳穿洪生心里的小九九。
第19集
回到老宅的丁远志拿出牡丹会会员卡，回想起钟文轩在病房里对自己说过的话，看着手中和钟文轩一模一样的会员卡，他想不通一生简朴的父亲为什么会出现在这样的场所里。丁远志在家中仔细查找，希望能找到关于父亲离世前更多的线索，一番搜寻后并未找到任何凭证，丁远志来到自己房间门口，突然脑中回想起母亲的离世时的往事，丁远志思考片刻转身离去。
第20集
李翘来到兰兰的病房，告知兰兰母亲会用其提供的资料对兰兰做研究，而且兰兰手术后会彻底康复，但兰兰母亲却并不开心。会议室内，丁远志带领众人探讨兰兰所谓的可以预测地震的奇异特长，并在接下来的24小时内不间断监测兰兰的脑电波。
第21集
兰兰的病情终于确诊。兰兰的癫痫属于“心理问题”，她因从小有癫痫而备受歧视，而兰母更怕女儿被别人瞧不起，所以对兰兰十分严苛，致使兰兰有讨好型人格，而为了满足母亲的期望，兰兰的癫痫变成“癔性发作”。
第22集
次日，韩西林与丁远志赶往日本，潘小艾偷偷来到老中医楼。原来在韩西林回到九院之时就已经开始秘密改良化瘤丹了，出国的这段日子，韩西林嘱托潘小艾帮忙照顾实验室。
第23集
在童健妻子口中，韩西林得到了令人震惊的消息，原来，日本成田医院的副院长川田佳子一直想聘用丁学坤为成田医院的中医顾问。
第24集
韩西林接到电话，竟有人投诉了自己。原来武得莉的儿子来到医院大闹，称其媳妇蔡宁因为吃了韩西林开的中药导致流产。
第25集
韩西林异常的行为让司徒院长与韩阔海心生疑问，司徒院长与韩阔海找到韩西林，询问为何突然同意成立化瘤丹改良小组，韩西林称这是自己母亲与丁学坤的遗愿，自己作为儿子和徒弟势必要完成。
第26集
韩阔海来到老中医楼，安慰着韩西林，并说明一切都不是韩西林的错，而是自己的错，因为是通过自己的介绍，丁学坤才与川田佳子相识。
第27集
正当韩西林与丁远志二人放弃调查之时，一次“上海国际医学交流会”让两人再次同行。与此同时丁远志从李翘口中得知，林雅婕并没有回老家，而是独自前往呼和浩特。
第28集
当年正是因为于墨葭与丁学坤不同意实行“双盲实验”，才使化瘤丹无法上市，这也成为司徒院长与丁学坤多年来的隔阂，自己的家庭也因此破裂。
第29集
林雅婕从王恒之口中得知今晚韩西林就会回到九院。夜晚，林雅婕来给韩西林送饺子，却不料碰到黑衣人，林雅婕惊慌失措，意外摔下楼梯，昏迷不醒。
第30集
韩西林与丁远志二人觉察，此次事件绝非偶然。二人分析，林雅婕的意外可能也是有人蓄意为之，而这个人应该就在九院中。王恒之回到办公室后，迅速与谷麦子取得联系，并告诉对方自己拿到改良配方后会第一时间与其联系。
第31集
夜晚，沈先知在病房外散步，意外与王恒之相遇，王恒之不断地逼问沈先知是否认识自己，而沈先知似乎认出了王恒之，并一直大叫坏人。
第32集
韩西林与丁远志在研究丁学坤留下的字卷，不明白字卷中到底有什么线索。此时，王恒之坐在办公室，回想起两个月前在自己生日时请求丁学坤的画面。
第33集
夜晚，韩西林对李泰和与胡自清表示王芷蘅脑中的肿瘤位置十分不好，所以自己想用化瘤丹试一试。而李泰和表示，如果这样就表明了化瘤丹改良成功，而之后韩西林所要面对的就是“双盲实验”。
第34集
司徒院长将韩西林、丁远志、王恒之找到自己办公室，并询问韩西林是用什么方法治疗王芷蘅，韩西林表示司徒院长应该早就想到自己怎么治疗了，并道破司徒院长把王芷蘅留在神内，就是想让自己为其使用化瘤丹。
第35集
从回到九院开始，王恒之就对韩西林百般阻挠，用尽一切手段，切断韩西林查到的每一个线索。时至今日，王恒之还在演戏，韩西林却已经看清了他的真面目，问他为什么要害死自己的师傅。
第36集
韩西林和丁远志看丁学坤生前留下来的视频，这意味着他们已经心无芥蒂，能够一起合作了。丁学坤在视频中让他们记住，名利带不走，污点抹不掉。