结核病的临床症状为长期低热、夜间盗汗、倦怠、乏力、食欲减退、消瘦、妇女月经不调、易怒、心悸、面颊潮红等。肺结核病的呼吸系统症状明显，如咳嗽咯痰、痰中带血或大口咯血、胸痛和呼吸困难等。X线检查可确诊患病的严重程度和类型。结核性腹膜炎有发热、腹胀、腹水、腹壁柔韧感和腹部包块等临床表现。严重的可发生肠粘连、肠梗阻和肠瘘。结核性脑膜炎则有头痛、呕吐、颈项强直、意识障碍、昏迷、抽风等症状。肾结核主要表现为尿频、尿急、尿痛、腰痛、腰酸、脓尿和血尿，常同时伴有肺结核、淋巴结结核、骨结核、附睾结核、精囊和前列腺结核等。肝脾肿大和黄疸是典型的肝结核症状，多数不能及时确诊。若有原因不明的长期发热，进行性肝大，持续性肝区疼痛及压痛者要警惕肝结核的可能性，如有必要可进行肝穿刺活组织检查。高度疑似肝结核，又未能得到病理或细菌学证实者，可试行诊断性治疗，进行抗结核化疗4～8周。如临床症状出现明显的改善，则有利于肝结核的诊断。
骨关节结核、皮肤结核和淋巴结结核等，临床表现都有其特征。