首先，我们来了解一下珍珠的来历，珍珠手链是一种古老的有机宝石，产在珍珠贝类和珠母贝类软体动物体内，由于内分泌作用而生成的 含碳酸钙的矿物(文石)珠粒，是由大量微小的文石晶体集合而成的。根据地质学和考古学的研究证明，在两亿年前，地球上就已经有了珍珠。国际宝石界还将珍珠列为六月生辰的幸运石，结婚十三周年和三十周年的纪念石。具有瑰丽色彩和高雅气质的珍珠，象征着健康、纯洁、富有和幸福，自古以来为人们所喜爱。 现在人工养殖的珍珠，就是根据上述原理，用人工的方法，从育珠蚌外套膜剪下活的上皮细胞小片(简称细胞小片)，与蚌壳制备的人工核、一起植入蚌的外套膜结缔组织中，植入的细胞小片，依靠结缔组织提供的营养，围绕人工核迅速增殖，形成珍珠囊，分泌珍珠质，从而生成人工有核珍珠。人工无核珍珠，是对外套膜施术时，仅植入细胞小片，经细胞增殖形成珍珠囊，并向囊内分泌珍珠质，生成的珍珠。
从上述珍珠的养殖过程我们便可以了解天然珍珠与养殖珍珠的不同，主要是在核上。天然的往往只是一些砂粒、细菌，核极小，甚至没有核，其生长环境是随机的，水体也无人为的影响。而养殖珍珠则有一个很大的核，珍珠的形成是在人工养殖场完成的。这样实际上就形成了两者本质的区别。
天然珍珠中的主要组成成份“文石”是呈放射状、从裏到外排列的；而人工养殖珍珠的核是“珠母贝”的壳层，因而其“文石”是水平层状向外生长的，只有到表皮增生的珍珠层才成放射状。
虽然我们已经知道了天然珍珠与养殖的结构区别，但由于其成分及外观都极相似，要在不损坏珍珠的情况下鉴别是天然还是养殖实在不容易，这项工作也是所有宝石鉴别中最复杂的，有时甚至要在实验使用大型科学仪器，如X－光衍射仪等才能完成。但是作为经验，下面的一些方法是有用的。
对于末穿孔的珍珠，可将它放在一个开1－2MM左右小孔的不透明档板前，在档板後面用强光照射，然後对著小孔透过的强光转动珍珠观察。如果是人工养殖珍珠，一般便可看见其核内部产生的条纹效应，即珍珠表面会出现一些明暗不一致的条纹。这种方法对于检测一些成串的珍珠更有效，如果成串珠都有条纹效应，便有足够理由怀疑它为养殖珍珠。但是，一些养殖时间较长、珠层较厚的养殖珠，有时也可不出现条纹，因而光凭没有条纹也不能马上肯定为天然珍珠，要给合下面的一些特征。
对于一些已穿孔的珍珠，用强光照射穿孔，用放大镜仔细观察，如果是养殖珍珠一般能看到珍珠内有一条褐色明显的界线，那是殖入的核与後来生长出来的珍珠层之间的分界部位。
用比重液进行区分。一般养殖珠由于其核是珍珠母贝壳，比重较一般的珍珠层大，养殖珍珠平均比重一般在2.75－2.76之间。而波斯湾天然珍珠比重平均为2.71变化；澳大利亚的天然珍珠比重变化在2.66－2.78之间。因而可以在比重为2.89G/cm2左右的三溴甲烷溶液中投入一块比重为2.72GCM2的冰洲石，然後缓慢加入二甲烷溶液，直到冰洲石处在漂浮状态，这时得到的比重液的密度为2.72左右。如果将珍珠投入，则80%的天然珍珠会上浮，而90%的养殖珍珠会下沈。但是必须说明的是，这种方法对珍珠的品质有影响，会使珍珠容易变质，从而易损坏，因而如不是大批量的抽样，最好不要做单独鉴定。
天然珍珠由于生长时间长，珍珠层厚，因而一般“珠光”圆润厚实，且表皮光滑，少“疱”。
多数养殖珍珠由于养殖时间短，往往1－2年甚至几个月就取珠，因而珠层薄，光泽带“蜡状”，珠光“浮”浅，更加上人工养殖珍珠的水体容易受微生物等生物病菌的侵扰，在养殖珠的表面往往易形成一些凹的小“脓疱”。
当然，上述鉴别方法是经验性的，只能作为综合的参考依据。
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