优化了故事情节。
魔法少女小圆剧场版有三部。《开始的物语》《永远的物语》《叛逆的物语》，其中前两部是动画版的重新编排内容没有变化，而《叛逆的物语》是全新的故事，讲述了小圆成神以后的故事，小焰有了大动作，具体就不剧透了。
《魔法少女小圆》是由Magica Quartet企划，新房昭之执导，虚渊玄剧本，SHAFT制作的原创电视动画。唯一同时获得日本动画指标性三大奖的电视动画，也是史上获奖最多的日本电视动画。于2011年1月7日起在每日放送首播，全12话。作品亦改编成同名漫画、游戏等。
《魔法少女小圆剧场版 [前篇] 起始的物语》和《魔法少女小圆剧场版 [后篇] 永远的物语》做为总集篇分别于2012年10月6日和2012年10月13日在日本上映。而小圆重构后的新世界《魔法少女小圆剧场版 [新篇] 叛逆的物语》于2013年10月26日上映。
以上内容参考：百度百科-魔法少女小圆
魔法少女小圆剧场版分三个部分吧tv版的剧情重制优化了一下而已，基本上是没什么区别的。
《魔法少女小圆》是由Magica Quartet企划，新房昭之执导，虚渊玄剧本，SHAFT制作的原创电视动画。唯一同时获得日本动画指标性三大奖的电视动画，也是史上获奖最多的日本电视动画。于2011年1月7日起在每日放送首播，全12话。作品亦改编成同名漫画、游戏等。
《魔法少女小圆剧场版 [前篇] 起始的物语》和《魔法少女小圆剧场版 [后篇] 永远的物语》做为总集篇分别于2012年10月6日和2012年10月13日在日本上映。而小圆重构后的新世界《魔法少女小圆剧场版 [新篇] 叛逆的物语》于2013年10月26日上映。
剧情：
就读初中二年级的鹿目圆，过着平凡幸福的生活。神秘转学生晓美焰的出现，开始让小圆的命运有了巨大转变。某日一只名为丘比的神秘生物，希望小圆能够与它签订魔法契约，成为“魔法少女”以对抗邪恶的魔女保护世界。
正当小圆犹豫烦恼之时，好友沙耶香先一步成为“魔法少女”后，两人才发现原来签订契约后，需付出的代价远比想象中巨大甚至残酷，这一切真相都再次冲击小圆想成为“魔法少女”的想法。
[前篇]
起始的物语》、《魔法少女小圆剧场版
[后篇]
永远的物语》二部曲把《魔法少女小圆》tv动画版以总集编的形式进行重新制作。
从这里看得出来，剧场版和tv并没多少区别，也就是剧场版是把tv链接起来减去一些剧情，画面重新设计，细节更加凸显，补充说明一些设定而已。
而第三部《魔法少女小圆剧场版
[新篇]
叛逆的物语》则讲述的是发生在电视版结局之后的全新剧情。