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我校十分重视继续医学教育工作。从五、六十年代开始，我校开展了旨在提高基层卫生技术人员医疗水平的进修教育，为省内兄弟院校和各级医疗单位培养师资和临床医师，到目前累计培养和培训各类卫生技术人员已达数万人次。八十年代初，受原卫生厅和原省教委的委托，举办了多批专业证书班和各种短训班;九十年代开始，我校又相继开展了对各类人员的在职培训，以及国家级、省级和校级的继续医学教育项目。
2003年，我校成立了“哈尔滨医科大学继续医学教育委员会”，按照国家有关文件的精神，逐步建立和完善了继续医学教育的各项规章制度。2010年开始，受省人力资源社会保障厅委托，我校开展了面向全省卫生专业技术人员的继续教育知识更新培训。